RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475060.1

CTPS1-207, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 813 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-207ENST00000475060 ERCC2P18074 760 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 PTPN3P26045 913 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 CLCNKBP51801 687 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 FAM189BP81408 668 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 OCRLQ01968 901 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 CRHR2Q13324 411 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 PPP2R5DQ14738 602 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 KRT72Q14CN4 511 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 TEX44Q53QW1 395 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 DCAF6Q58WW2 860 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 FYB2Q5VWT5 728 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 AFMIDQ63HM1 303 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 ICE2Q659A1 982 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 MSANTD2Q6P1R3 559 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 TRAF7Q6Q0C0 670 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 LRRC49Q8IUZ0 686 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 ZNF567Q8N184 647 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 LZTR1Q8N653 840 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 SLC43A3Q8NBI5 491 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 SMC1BQ8NDV3 1235 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 CDKL2Q92772 493 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 PTPRN2Q92932 1015 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 MYLPFQ96A32 169 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 SKA1Q96BD8 255 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 ANKRD27Q96NW4 1050 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 LRRC37BQ96QE4 947 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 HAPLN3Q96S86 360 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 APOL6Q9BWW8 343 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 GBA3Q9H227 469 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 SMOC2Q9H3U7 446 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 OCEL1Q9H607 264 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 KCNK13Q9HB14 408 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 RRAGCQ9HB90 399 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 MLXIPLQ9NP71 852 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 ANLNQ9NQW6 1124 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 IL37Q9NZH6 218 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 SLC17A7Q9P2U7 560 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 CHD5Q8TDI0 1954 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 MYO16Q9Y6X6 1858 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 CLDN5O00501 218 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 MGEA5O60502 916 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 SIN3BO75182 1162 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 GLRA3O75311 464 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 AVILO75366 819 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 OAZ2O95190 189 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 EOMESO95936 686 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 BPGMP07738 259 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 T-ENOLP0DO92 83 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 RARBP10826 455 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 SLC8A1P32418 973 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 HADHAP40939 763 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 GARSP41250 739 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 POLD2P49005 469 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 NPY2RP49146 381 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 NDUFV1P49821 464 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 RASSF2P50749 326 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 SCNN1GP51170 649 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 CCNG1P51959 295 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 CACNA2D1P54289 1103 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 MAP3K7CLP57077 242 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 MTA1Q13330 715 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 LPIN1Q14693 890 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 CRYMQ14894 314 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 SETDB1Q15047 1291 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 SNCBQ16143 134 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 GNASQ5JWF2 1037 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 ATG16L1Q676U5 607 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 CXCL17Q6UXB2 119 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 PACS1Q6VY07 963 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 DSTYKQ6XUX3 929 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-207ENST00000475060 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms