RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474181.1

UBE2Q1-203, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2Q1, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-203ENST00000474181 GMIPQ9P107 970 aa13.2□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 SAMD15Q9P1V8 674 aa13.2□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa13.2□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 NR2E3Q9Y5X4 410 aa13.2□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 MTMR11A4FU01 709 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 I6L893 689 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 KCNK1O00180 336 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 DFFAO00273 331 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 PSMD3O43242 534 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 MSI1O43347 362 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 NEBLO76041 1014 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 CXCL10P02778 98 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 GALTP07902 379 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 CA4P22748 312 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 PTPN3P26045 913 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 GARSP41250 739 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 MAGEA3P43357 314 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 PSEN1P49768 467 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 WASHC5Q12768 1159 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 GPR17Q13304 367 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 SPARCL1Q14515 664 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 FAM182AQ5T1J6 154 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 HHATQ5VTY9 493 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 LRRC8BQ6P9F7 803 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 CCNJLQ8IV13 435 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 LRRC34Q8IZ02 419 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 C4orf33Q8N1A6 199 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 ATPAF2Q8N5M1 289 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 NPWQ8N729 165 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 PPM1NQ8N819 430 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 ATAD1Q8NBU5 361 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 DCAKDQ8WVC6 231 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 SLC44A1Q8WWI5 657 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 CKAP2Q8WWK9 683 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 B3GALT6Q96L58 329 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 TTPALQ9BTX7 342 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 MLXIPLQ9NP71 852 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 TTLL3Q9Y4R7 772 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 PLXNA3P51805 1871 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 SDR42E2A6NKP2 422 aa13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRT37O76014 449 aa13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 UPP2O95045 317 aa13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 AMHP03971 560 aa13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 SLC18A1P54219 525 aa13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 TLE2Q04725 743 aa13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 ZNF33AQ06730 810 aa13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 EFEMP1Q12805 493 aa13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 IKBKEQ14164 716 aa13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 TCTN1Q2MV58 587 aa13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 TRIM60Q495X7 471 aa13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 UNC5AQ6ZN44 842 aa13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 ZNF534Q76KX8 674 aa13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 SLC26A11Q86WA9 606 aa13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 CCDC197Q8NCU1 140 aa13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 CDKL2Q92772 493 aa13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 SIGLEC10Q96LC7 697 aa13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 MAGEB18Q96M61 343 aa13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 NAT9Q9BTE0 207 aa13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 GBA3Q9H227 469 aa13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 CLIC5Q9NZA1 410 aa13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 GGA2Q9UJY4 613 aa13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 NUDT5Q9UKK9 219 aa13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 TLR6Q9Y2C9 796 aa13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 TCP11X1B4DZS4 312 aa13.17□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRT38O76015 456 aa13.17□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 ZWINTO95229 277 aa13.17□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 PGAM1P18669 254 aa13.17□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 MGAT1P26572 445 aa13.17□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 SERPINB9P50453 376 aa13.17□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 TUBP50607 506 aa13.17□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 RTP2Q5QGT7 225 aa13.17□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 C10orf120Q5SQS8 335 aa13.17□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 NUGGCQ68CJ6 796 aa13.17□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 KIAA1841Q6NSI8 718 aa13.17□□□□□ -0.3
UBE2Q1-203ENST00000474181 CNKSR3Q6P9H4 555 aa13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms