RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472800.1

AUP1-207, Transcript of AUP1, lipid droplet regulating VLDL assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene AUP1, Length 663 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1-207ENST00000472800 ZNF662Q6ZS27 426 aa20.3■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 C14orf80Q86SX3 495 aa20.3■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 FIBINQ8TAL6 211 aa20.3■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 TEKT4Q8WW24 435 aa20.3■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 DESI2Q9BSY9 194 aa20.3■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.3■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 LACRTQ9GZZ8 138 aa20.3■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 LTB4R2Q9NPC1 389 aa20.3■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa20.3■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 PLK2Q9NYY3 685 aa20.3■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa20.3■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 A0A1B0GVM2 712 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 TCAF2A6NFQ2 919 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 E9PAM4 449 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 STK25O00506 426 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 APODP05090 189 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 KRT7P08729 469 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 CCDC175P0C221 793 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 TNFRSF4P43489 277 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 SLC6A11P48066 632 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 DGKGP49619 791 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 SGSHP51688 502 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 CLCN5P51795 746 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 CDH4P55283 916 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 PON2Q15165 354 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 FBXO43Q4G163 708 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 DGKKQ5KSL6 1271 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 MANEALQ5VSG8 457 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 GRAMD4Q6IC98 578 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 CHST9Q7L1S5 443 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 C12orf40Q86WS4 652 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 ZNF687Q8N1G0 1237 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 CFAP52Q8N1V2 620 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 SYNPOQ8N3V7 929 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 TMEM105Q8N8V8 129 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 BHMTQ93088 406 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 IGSF8Q969P0 613 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 MYEOVQ96EZ4 313 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 P2RY11Q96G91 374 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 ZYG11BQ9C0D3 744 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 STIM2Q9P246 746 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 TFR2Q9UP52 801 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 AP4E1Q9UPM8 1137 aa20.29■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 MYOFQ9NZM1 2061 aa20.28■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 FAM170BA6NMN3 283 aa20.28■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 TIMM44O43615 452 aa20.28■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 KRT86O43790 486 aa20.28■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 SRGAP2O75044 1071 aa20.28■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 CD72P21854 359 aa20.28■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 LRRC32Q14392 662 aa20.28■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 E2F5Q15329 346 aa20.28■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 C11orf63Q6NUN7 778 aa20.28■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 MFN1Q8IWA4 741 aa20.28■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 PHTF2Q8N3S3 785 aa20.28■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 TPCN2Q8NHX9 752 aa20.28■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa20.28■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 PEBP4Q96S96 227 aa20.28■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 EPAS1Q99814 870 aa20.28■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 ARHGEF4Q9NR80 690 aa20.28■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 DONSONQ9NYP3 566 aa20.28■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 SIT1Q9Y3P8 196 aa20.28■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 DUSP10Q9Y6W6 482 aa20.28■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 KAT7O95251 611 aa20.27■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 RARAP10276 462 aa20.27■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 IL1R2P27930 398 aa20.27■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 SSR1P43307 286 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 MAGEA9P43362 315 aa20.27■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 HCAR3P49019 387 aa20.27■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 SEMA3BQ13214 749 aa20.27■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 SLC12A1Q13621 1099 aa20.27■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 UBXN2BQ14CS0 331 aa20.27■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 LRRC38Q5VT99 294 aa20.27■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 FSTL4Q6MZW2 842 aa20.27■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 POLNQ7Z5Q5 900 aa20.27■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 TERB1Q8NA31 727 aa20.27■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 KCNV2Q8TDN2 545 aa20.27■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 CLDN23Q96B33 292 aa20.27■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 TBC1D31Q96DN5 1066 aa20.27■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 SALL4Q9UJQ4 1053 aa20.27■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 SNX10Q9Y5X0 201 aa20.27■□□□□ 0.84
AUP1-207ENST00000472800 TBC1D3BA6NDS4 549 aa20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms