RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		18.33	■□□□□ 0.53
USP19-210	ENST00000465902	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	APBB3	O95704	486 aa		18.33	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	TDGF1	P13385	188 aa		18.33	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	HOXB2	P14652	356 aa		18.33	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	CD70	P32970	193 aa		18.33	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	DGKE	P52429	567 aa		18.33	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	CRY1	Q16526	586 aa		18.33	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		18.33	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	RAB6C	Q53S08	254 aa		18.33	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	18.33	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		18.33	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	STRADA	Q7RTN6	431 aa		18.33	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	C14orf80	Q86SX3	495 aa		18.33	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	AHI1	Q8N157	1196 aa		18.33	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		18.33	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		18.33	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		18.33	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		18.33	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	IGSF8	Q969P0	613 aa		18.33	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	TRIM11	Q96F44	468 aa		18.33	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		18.33	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	DEF6	Q9H4E7	631 aa		18.33	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	18.33	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		18.33	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		18.33	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		18.33	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		18.33	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	EML5	Q05BV3	1969 aa		18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902		A0A087X0T9	212 aa		18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	CCP110	O43303	1012 aa		18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	TIMM44	O43615	452 aa		18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	SRGAP2	O75044	1071 aa		18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	ADAM23	O75077	832 aa		18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	ALDH1A2	O94788	518 aa		18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	ENDOD1	O94919	500 aa		18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	FAM228B	P0C875	321 aa		18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	LMAN2	Q12907	356 aa		18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	MAMLD1	Q13495	774 aa		18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	E2F5	Q15329	346 aa		18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	TMEM215	Q68D42	235 aa		18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	ANO7	Q6IWH7	933 aa		18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	LRRC31	Q6UY01	552 aa		18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	LONP2	Q86WA8	852 aa		18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	PGBD3	Q8N328	593 aa		18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	CNPY3	Q9BT09	278 aa		18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	ISCU	Q9H1K1	167 aa		18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	HCN2	Q9UL51	889 aa		18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		18.32	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902		A0A1B0GVM2	712 aa		18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	WASH3P	C4AMC7	463 aa		18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902		I6L893	689 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	MFAP3L	O75121	409 aa		18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	MOCS3	O95396	460 aa		18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	MYBL1	P10243	752 aa		18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	PSMA2	P25787	234 aa		18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	NUMB	P49757	651 aa		18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	HDAC4	P56524	1084 aa		18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	FSCB	Q5H9T9	825 aa		18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	MBLAC2	Q68D91	279 aa		18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	BNIPL	Q7Z465	357 aa		18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	CNGA4	Q8IV77	575 aa		18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	DRC7	Q8IY82	874 aa		18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	HAPLN3	Q96S86	360 aa		18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	DNAJC7	Q99615	494 aa		18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		18.31	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		18.3	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		18.3	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	AXIN1	O15169	862 aa		18.3	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
USP19-210	ENST00000465902	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52

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