RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AP5Z1O43299 807 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DLDP09622 509 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CHRNB2P17787 502 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SCNN1AP37088 669 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 STAT1P42224 750 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 COPAP53621 1224 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FMO1Q01740 532 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CDR2Q01850 454 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMPRSS6Q8IU80 811 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DEFB119Q8N690 84 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF366Q8N895 744 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MSANTD4Q8NCY6 345 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PIGKQ92643 395 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ERGIC2Q96RQ1 377 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NPY6RQ99463 290 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BPIFA3Q9BQP9 254 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RTKNQ9BST9 563 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 H0Y626 953 aa16.09■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GOLGA8SH3BPF8 625 aa16.09■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC30A4O14863 429 aa16.09■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CSKP41240 450 aa16.09■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SULT1E1P49888 294 aa16.09■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LYSMD4Q5XG99 296 aa16.09■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FBXL22Q6P050 247 aa16.09■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CACUL1Q86Y37 369 aa16.09■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TTC17Q96AE7 1141 aa16.09■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SIPA1Q96FS4 1042 aa16.09■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PIGVQ9NUD9 493 aa16.09■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RRN3Q9NYV6 651 aa16.09■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 STAP1Q9ULZ2 295 aa16.09■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DCDC2BA2VCK2 349 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PATE3B3GLJ2 98 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ITPKAP23677 461 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FLT3P36888 993 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GGCXP38435 758 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PITRM1Q5JRX3 1037 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RABGAP1LQ5R372 815 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR2T3Q8NH03 318 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NT5C3BQ969T7 300 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MYO19Q96H55 970 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TBCBQ99426 244 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ITM2CQ9NQX7 267 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM74BQ9NUR3 256 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HS3ST4Q9Y661 456 aa16.08■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CEP192Q8TEP8 1941 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A0A1B0GVM2 712 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LNP1A1A4G5 178 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TCAF2A6NFQ2 919 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SMTNL1A8MU46 457 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PAGE1O75459 146 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ADCY5O95622 1261 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ASLP04424 464 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CD6P30203 668 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CXCR3P49682 368 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TPMTP51580 245 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LIMK1P53667 647 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CENPCQ03188 943 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF33AQ06730 810 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MTA1Q13330 715 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AUHQ13825 339 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC25A52Q3SY17 297 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 STPG1Q5TH74 334 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRNP1Q6NT89 227 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRIM72Q6ZMU5 477 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SYT12Q8IV01 421 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 APCDD1Q8J025 514 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC30A5Q8TAD4 765 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IGSF8Q969P0 613 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MRGPRX3Q96LB0 322 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HSPA12BQ96MM6 686 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EDEM2Q9BV94 578 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TKTL2Q9H0I9 626 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANLNQ9NQW6 1124 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM59LQ9UK28 342 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 VANGL2Q9ULK5 521 aa16.07■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 I6L893 689 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TEX33O43247 280 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms