RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-202ENST00000444040 PPM1JQ5JR12 505 aa16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-202ENST00000444040 FAM35AQ86V20 835 aa16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-202ENST00000444040 RASSF3Q86WH2 238 aa16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-202ENST00000444040 NPWQ8N729 165 aa16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-202ENST00000444040 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
SHQ1-202ENST00000444040 ATP2A3Q93084 1043 aa16.41■□□□□ 0.22
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