RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 FGD3Q5JSP0 725 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CST9Q5W186 159 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 RGMBQ6NW40 437 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNK16Q96T55 309 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 FERMT1Q9BQL6 677 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF341Q9BYN7 854 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 KLHL25Q9H0H3 589 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 FETUBQ9UGM5 382 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 POU2F3Q9UKI9 436 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0B4J269 797 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 TSPAN6O43657 245 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 TOM1L1O75674 476 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP11B1P15538 503 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 MAP2K5Q13163 448 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 TUBB3Q13509 450 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 FLOT2Q14254 428 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 NFIL3Q16649 462 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ACAD10Q6JQN1 1059 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 SH2D5Q6ZV89 423 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 OR8H2Q8N162 312 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 SIX5Q8N196 739 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC15A4Q8N697 577 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF148Q8N7C7 305 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CEP95Q96GE4 821 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 HIPK3Q9H422 1215 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PCIF1Q9H4Z3 704 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 C7orf72A4D263 438 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD34BA5PLL1 514 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CFAP99D6REC4 459 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 NOP56O00567 594 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ESRRBO95718 433 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP3A4P08684 503 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 NR4A1P22736 598 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNC4Q03721 635 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 STX3Q13277 289 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP2R5DQ14738 602 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 DEFB115Q30KQ5 88 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 IL31Q6EBC2 164 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM72Q6ZMU5 477 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 RASAL3Q86YV0 1011 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CTAGE3PQ8IX95 158 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PEX5LQ8IYB4 626 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM71AQ8IYT1 594 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 WNK4Q96J92 1243 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 KREMEN1Q96MU8 473 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM79Q9BSE2 394 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PARVBQ9HBI1 364 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 VPS45Q9NRW7 570 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 DKK3Q9UBP4 350 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 GNPTGQ9UJJ9 305 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 SORCS3Q9UPU3 1222 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNH4Q9UQ05 1017 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 NFASCO94856 1347 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 KLHL41O60662 606 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 GNRH1P01148 92 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 INHBBP09529 407 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 JAK1P23458 1154 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 MAPK10P53779 464 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CETN1Q12798 172 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR107Q5VW38 600 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 RHOT1Q8IXI2 618 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 TRPC4APQ8TEL6 797 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CMTM5Q96DZ9 223 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 SGF29Q96ES7 293 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 DAPK2Q9UIK4 370 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ERGIC3Q9Y282 383 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CARD8Q9Y2G2 431 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PLLPQ9Y342 182 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM114B3SHH9 223 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 H3BMQ9 156 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 AIM2O14862 343 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms