RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 UCHL3P15374 230 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 GNA15P30679 374 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 KLK7P49862 253 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 DAOAP59103 153 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARID5AQ03989 594 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 ADIGQ0VDE8 80 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 E2F5Q15329 346 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 DCAF12L1Q5VU92 463 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 DENND1BQ6P3S1 775 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 LUZP1Q86V48 1076 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 GALNT15Q8N3T1 639 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 WDTC1Q8N5D0 677 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 STK32AQ8WU08 396 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 HSFY1Q96LI6 401 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 CNGB3Q9NQW8 809 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 TM7SF3Q9NS93 570 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 CYTH4Q9UIA0 394 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 PCDHGC3Q9UN70 934 aa11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 DSPP15924 2871 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 YJEFN3A6XGL0 299 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRRT4C9JH25 899 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 E7ENQ6 273 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 EPHB6O15197 1021 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 FLRT2O43155 660 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 PTMAP06454 111 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 OXTRP30559 389 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 CCDC157Q569K6 752 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 HTR3DQ70Z44 454 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 TADA2BQ86TJ2 420 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 CACUL1Q86Y37 369 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARHGAP18Q8N392 663 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 RHBDD1Q8TEB9 315 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 IRGQQ8WZA9 623 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 ERGIC2Q96RQ1 377 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 CDC6Q99741 560 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC4A5Q9BY07 1137 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 STK33Q9BYT3 514 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 LRRC4Q9HBW1 653 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 SCUBE2Q9NQ36 999 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 PLK2Q9NYY3 685 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 MARK1Q9P0L2 795 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 DNMT3LQ9UJW3 386 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 NAGPAQ9UK23 515 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 NUDT5Q9UKK9 219 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 STON1Q9Y6Q2 735 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 NBEAQ8NFP9 2946 aa11.29□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 WASH3PC4AMC7 463 aa11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 F8VZ95 297 aa11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 PES1O00541 588 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 NPC1O15118 1278 aa11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 MDM4O15151 490 aa11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 THAP12O43422 761 aa11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 MED7O43513 233 aa11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 ADCY5O95622 1261 aa11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 CAPNS1P04632 268 aa11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF883P0CG24 379 aa11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 RGS7P49802 495 aa11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 JAM2P57087 298 aa11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 FUT11Q495W5 492 aa11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 C10orf120Q5SQS8 335 aa11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q6ZNB5 142 aa11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 GLRX5Q86SX6 157 aa11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM110Q86TL2 294 aa11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLCO6A1Q86UG4 719 aa11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC47A2Q86VL8 602 aa11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 CADM4Q8NFZ8 388 aa11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 CLEC4CQ8WTT0 213 aa11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 SIPA1Q96FS4 1042 aa11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRIM5Q9C035 493 aa11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 IL21RQ9HBE5 538 aa11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 HCN2Q9UL51 889 aa11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 FREM2Q5SZK8 3169 aa11.28□□□□□ -0.6
APOBEC3C-202ENST00000428892 PIK3R2O00459 728 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-202ENST00000428892 STC2O76061 302 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-202ENST00000428892 FBXO21O94952 628 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-202ENST00000428892 CYBBP04839 570 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-202ENST00000428892 FYNP06241 537 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-202ENST00000428892 RALAP11233 206 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-202ENST00000428892 LCP1P13796 627 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-202ENST00000428892 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-202ENST00000428892 USP8P40818 1118 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRSS12P56730 875 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-202ENST00000428892 PTK2Q05397 1052 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-202ENST00000428892 PDCLQ13371 301 aa11.27□□□□□ -0.61
APOBEC3C-202ENST00000428892 RAPGEF1Q13905 1077 aa11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.4 ms