RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa11.1□□□□□ -0.63
ATG4B-210ENST00000428861 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP11.1□□□□□ -0.63
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ATG4B-210ENST00000428861 ENDOD1O94919 500 aa11.1□□□□□ -0.63
ATG4B-210ENST00000428861 CAVIN2O95810 425 aa11.1□□□□□ -0.63
ATG4B-210ENST00000428861 SLC2A3P11169 496 aa11.1□□□□□ -0.63
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ATG4B-210ENST00000428861 MRGPRX1Q96LB2 322 aa11.1□□□□□ -0.63
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ATG4B-210ENST00000428861 TIMM44O43615 452 aa11.09□□□□□ -0.63
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ATG4B-210ENST00000428861 DLDP09622 509 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 KRT3P12035 628 aa11.08□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 PLEKHG6Q3KR16 790 aa11.08□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 PMS2CLQ68D20 193 aa11.08□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 SDE2Q6IQ49 451 aa11.08□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 CCDC185Q8N715 623 aa11.08□□□□□ -0.64
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