RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428075.5

TRIOBP-209, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene TRIOBP, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-209ENST00000428075 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
TRIOBP-209ENST00000428075 KCNMA1Q12791 1236 aa28.9■■■□□ 2.22
TRIOBP-209ENST00000428075 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
TRIOBP-209ENST00000428075 VWA3BQ502W6 1294 aa28.9■■■□□ 2.22
TRIOBP-209ENST00000428075 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa28.9■■■□□ 2.22
TRIOBP-209ENST00000428075 FAM71AQ8IYT1 594 aa28.9■■■□□ 2.22
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
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TRIOBP-209ENST00000428075 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa28.9■■■□□ 2.22
TRIOBP-209ENST00000428075 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
TRIOBP-209ENST00000428075 SUSD2Q9UGT4 822 aa28.9■■■□□ 2.22
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TRIOBP-209ENST00000428075 GLI1P08151 1106 aa28.89■■■□□ 2.22
TRIOBP-209ENST00000428075 BNC1Q01954 994 aa28.89■■■□□ 2.22
TRIOBP-209ENST00000428075 PTK2Q05397 1052 aa28.89■■■□□ 2.22
TRIOBP-209ENST00000428075 PITRM1Q5JRX3 1037 aa28.89■■■□□ 2.22
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TRIOBP-209ENST00000428075 OLFML1Q6UWY5 402 aa28.89■■■□□ 2.22
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TRIOBP-209ENST00000428075 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
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TRIOBP-209ENST00000428075 ASNSD1Q9NWL6 643 aa28.89■■■□□ 2.22
TRIOBP-209ENST00000428075 OPHN1O60890 802 aa28.88■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 SYPP08247 313 aa28.88■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 GNSP15586 552 aa28.88■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 GRIK2Q13002 908 aa28.88■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 CDH18Q13634 790 aa28.88■■■□□ 2.21
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TRIOBP-209ENST00000428075 CHSY1Q86X52 802 aa28.88■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 APCDD1Q8J025 514 aa28.88■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 ADAM33Q9BZ11 813 aa28.88■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 NUP62CLQ9H1M0 184 aa28.88■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 FBRSQ9HAH7 460 aa28.88■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP28.88■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 SUN2Q9UH99 717 aa28.88■■■□□ 2.21
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TRIOBP-209ENST00000428075 KNL1Q8NG31 2342 aa28.87■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 A0A1B0GTW7 788 aa28.87■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 FAM193AP78312 1265 aa28.87■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
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TRIOBP-209ENST00000428075 CLEC17AQ6ZS10 378 aa28.87■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 FAM114A1Q8IWE2 563 aa28.87■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 HDDC3Q8N4P3 179 aa28.87■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa28.87■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 FAM204AQ9H8W3 233 aa28.87■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 LMBRD1Q9NUN5 540 aa28.87■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 DDIT4Q9NX09 232 aa28.87■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 ERVW-1Q9UQF0 538 aa28.87■■■□□ 2.21
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TRIOBP-209ENST00000428075 ASLP04424 464 aa28.86■■■□□ 2.21
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TRIOBP-209ENST00000428075 CDK17Q00537 523 aa28.86■■■□□ 2.21
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TRIOBP-209ENST00000428075 ARID5BQ14865 1188 aa28.86■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 OR6B2Q6IFH4 312 aa28.86■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
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TRIOBP-209ENST00000428075 IRAK1P51617 712 aa28.84■■■□□ 2.21
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TRIOBP-209ENST00000428075 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 AKAP13Q12802 2813 aa28.83■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 F5H5T6 163 aa28.83■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 DAB1O75553 588 aa28.83■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 KRT37O76014 449 aa28.83■■■□□ 2.21
TRIOBP-209ENST00000428075 DNTTP04053 509 aa28.83■■■□□ 2.21
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