RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 VKORC1Q9BQB6 163 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPON2Q9BUD6 331 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 TUBB2BQ9BVA1 445 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 EPN3Q9H201 632 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 AAMDCQ9H7C9 122 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAGEE1Q9HCI5 957 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNX15Q9NRS6 342 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ABCF3Q9NUQ8 709 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARL8BQ9NVJ2 186 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 JKAMPQ9P055 326 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 IL36RNQ9UBH0 155 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRODH2Q9UF12 536 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRSS50Q9UI38 385 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 TUBE1Q9UJT0 475 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SERTAD3Q9UJW9 196 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLK12Q9UKR0 248 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 STRIP2Q9ULQ0 834 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 CES2O00748 559 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 AKR1B10O60218 316 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 DFNA5O60443 496 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPR32O75388 356 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRT37O76014 449 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SOX30O94993 753 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 MOCS3O95396 460 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGKV2D-28P01615 120 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 C9P02748 559 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC5A1P13866 664 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ST6GAL1P15907 406 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCNA3P22001 575 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 MCM3P25205 808 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPIFP30405 207 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 DIO1P49895 249 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF136P52737 540 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PER3P56645 1201 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDC42EP1Q00587 391 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 MTM1Q13496 603 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 GBX1Q14549 363 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADRM1Q16186 407 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARHGAP44Q17R89 818 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 AMZ1Q400G9 498 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPR158Q5T848 1215 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SFMBT2Q5VUG0 894 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 NSMFQ6X4W1 530 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 BRD3OSQ6XYD6 125 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTCHD4Q6ZW05 846 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF365Q70YC5 407 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF367Q7RTV3 350 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMC4Q7Z404 712 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 C14orf80Q86SX3 495 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPSM1Q86YR5 675 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 YAF2Q8IY57 180 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIAA1958Q8N8K9 716 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF540Q8NDQ6 660 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC17A8Q8NDX2 589 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 GSTCDQ8NEC7 633 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 C17orf47Q8NEP4 570 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC24A4Q8NFF2 622 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR14C36Q8NHC7 312 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTPRN2Q92932 1015 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 MPP4Q96JB8 637 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLMNQ96JQ2 1002 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRC61Q9BV99 259 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 LDAHQ9H6V9 325 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC52A3Q9NQ40 469 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM118AQ9NWS6 357 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF319Q9P2F9 582 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLAAQ9Y263 795 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 COQ6Q9Y2Z9 468 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 NAV2Q8IVL1 2488 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A0U1RQJ8 604 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1W2PQM1 296 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMIM1B2RUZ4 78 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM178BH3BS89 294 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 M0R3H8 397 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 CAPN9O14815 690 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZFAND5O76080 213 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 NPTXRO95502 500 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PMS2P2O95744 297 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANXA1P04083 346 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACADMP11310 421 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIR2DS4P43632 304 aa-0.75□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms