RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 KIF9Q9HAQ2 790 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 RRN3Q9NYV6 651 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 LGALS13Q9UHV8 139 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1W2PPM1 405 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 HACD1B0YJ81 288 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNK1O00180 336 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 DCLK1O15075 740 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PBX3P40426 434 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 MSH2P43246 934 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CXCR3P49682 368 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 GPR15P49685 360 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 DPYSQ14117 519 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PDK1Q15118 436 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CTXN3Q4LDR2 81 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PID1Q7Z2X4 250 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 ATAD1Q8NBU5 361 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 GPR152Q8TDT2 470 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SEPT8Q92599 483 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CHMP6Q96FZ7 201 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 OLFM3Q96PB7 478 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 FERMT1Q9BQL6 677 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 GPR62Q9BZJ7 368 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PHACTR1Q9C0D0 580 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF208Q9H0X6 261 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 EURLQ9NYK6 297 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 ADAM28Q9UKQ2 775 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TEX264Q9Y6I9 313 aa4.1□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A0A0MRY4 1105 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF103O00237 685 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TNFRSF10BO14763 440 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 MSI1O43347 362 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 STK10O94804 968 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 LRIG2O94898 1065 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 UPP2O95045 317 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 OAZ2O95190 189 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 STX2P32856 288 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 AIF1P55008 147 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PRMT2P55345 433 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SCAPQ12770 1279 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 KLHL38Q2WGJ6 581 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 C4orf22Q6V702 233 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 DEFB128Q7Z7B8 93 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TRABD2AQ86V40 505 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TDRPQ86YL5 185 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CTAGE3PQ8IX95 158 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRC34Q8IZ02 419 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SPATA13Q96N96 652 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CYTH2Q99418 400 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PAFAH2Q99487 392 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TRABDQ9H4I3 376 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 ACSS3Q9H6R3 686 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 NMUR1Q9HB89 426 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PNPLA8Q9NP80 782 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 ABCC13Q9NSE7 274 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC24A2Q9UI40 661 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 IKBKGQ9Y6K9 419 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TTC3P53804 2025 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1W2PQH9 124 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TBKBP1A7MCY6 615 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 GOLGA8RI6L899 631 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 DNM1LO00429 736 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SOAT2O75908 522 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 S1PR4O95977 384 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CPP00450 1065 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CPB1P15086 417 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 DRD4P21917 467 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC11A1P49279 550 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 GLUD2P49448 558 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SARNPP82979 210 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SEMA3BQ13214 749 aa4.09□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TCTN1Q2MV58 587 aa4.09□□□□□ -1.75
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