RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 USP17L7P0C7H9 530 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 DARSP14868 501 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 SCARA3Q6AZY7 606 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 FAM71AQ8IYT1 594 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 TINF2Q9BSI4 451 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 ATXN3LQ9H3M9 355 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 RANBP1P43487 201 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 TBL1YQ9BQ87 522 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 SLC39A12Q504Y0 691 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL4Q9C0H6 718 aa20.69■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 IGSF6O95976 241 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 PCNAP12004 261 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 RFX3P48380 749 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 GRIK5Q16478 980 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 MCOLN3Q8TDD5 553 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 SHC3Q92529 594 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 BBS2Q9BXC9 721 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 CROTQ9UKG9 612 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 STARD13Q9Y3M8 1113 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 DYRK3O43781 588 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 TSPAN3O60637 253 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 MAMLD1Q13495 774 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 SLC45A4Q5BKX6 768 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 OR56A4Q8NGH8 313 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 METTL6Q8TCB7 284 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 NSMCE2Q96MF7 247 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 SLC4A9Q96Q91 983 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC142Q17RM4 750 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 CES3Q6UWW8 571 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 CATSPER2Q96P56 530 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 PANX3Q96QZ0 392 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 MARCH2Q9P0N8 246 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 PADI4Q9UM07 663 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 DEPDC5O75140 1603 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 ASTN1O14525 1302 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 SERPINB1P30740 379 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 PRMT9Q6P2P2 845 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 SYTL1Q8IYJ3 562 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 MIER2Q8N344 545 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 ASB2Q96Q27 587 aa20.68■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 SPTLC1O15269 473 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D12O60347 775 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 KLRC2P26717 231 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF614Q8N883 585 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 WDR18Q9BV38 432 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 MID1IP1Q9NPA3 183 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 COMMD8Q9NX08 183 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFAF1Q9Y375 327 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 ADRB2P07550 413 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 FASP25445 335 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 MMP13P45452 471 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 MAFO75444 373 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 NPM3O75607 178 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 POU1F1P28069 291 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 CCT8P50990 548 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 TBCELQ5QJ74 424 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 WASHC2DQ5SRD0 308 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 NEPROQ6NW34 567 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 CERS5Q8N5B7 392 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 ATG16L2Q8NAA4 619 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 OR12D3Q9UGF7 316 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 CYP1A2P05177 515 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 ALADP13716 330 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 PPP2R1BP30154 601 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 BCL2L1Q07817 233 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 VAC14Q08AM6 782 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 C10orf53Q8N6V4 93 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 HSD17B14Q9BPX1 270 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 PRRG3Q9BZD7 231 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 IL22Q9GZX6 179 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 EPS8L2Q9H6S3 715 aa20.67■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0A0MRY4 1105 aa20.66■□□□□ 0.9
CCSAP-203ENST00000366687 PCDH8O95206 1070 aa20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.4 ms