RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANO7Q6IWH7 933 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF813Q6ZN06 617 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF66Q6ZN08 573 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 RASGRP2Q7LDG7 609 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 RFX6Q8HWS3 928 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD44Q8N8A2 993 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 C8orf58Q8NAV2 365 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZFPM2Q8WW38 1151 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARRDC3Q96B67 414 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 C5orf34Q96MH7 638 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 FCRL5Q96RD9 977 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 SFXN1Q9H9B4 322 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLEKHA2Q9HB19 425 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 NOD2Q9HC29 1040 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERVK-5Q9HDB9 667 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 RIC8AQ9NPQ8 531 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 PI4KBQ9UBF8 816 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC25A13Q9UJS0 675 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC8A2Q9UPR5 921 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 RCE1Q9Y256 329 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 COX11Q9Y6N1 276 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 DSCR3O14972 297 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPFIA2O75334 1257 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLAUP00749 431 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 ENO1P06733 434 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNPP09543 421 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 CSF1P09603 554 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 RFPL3SP0C7P2 107 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 CKMT1AP12532 417 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACP5P13686 325 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHN1P15882 459 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 ST6GAL1P15907 406 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPS6KB1P23443 525 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNTFP26441 200 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 CERS1P27544 350 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBE3AQ05086 875 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDK18Q07002 472 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 GOLGA8FQ08AF8 430 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXF2Q12947 444 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR162Q16538 588 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM110CQ1W6H9 321 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 GXYLT1Q4G148 440 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 RUNDC3AQ59EK9 446 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 RHPN2Q8IUC4 686 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINS1Q8NG48 757 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF398Q8TD17 642 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 HERVK_113Q902F9 699 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNJ9Q92806 393 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 KAT2BQ92831 832 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAP4K1Q92918 833 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 TWNKQ96RR1 684 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 CRAMP1Q96RY5 1269 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 NPAS1Q99742 590 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM118BQ9BPY3 351 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 TM2D2Q9BX73 214 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 RMI1Q9H9A7 625 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDGFCQ9NRA1 345 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 C11orf21Q9P2W6 132 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDR17Q8IZU2 1322 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 WIPF3A6NGB9 483 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 NPIPB13A6NJU9 1138 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 SAC3D1A6NKF1 404 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 NPIPB5A8MRT5 1133 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 NPIPB4C9JG80 1138 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 MCIDASD6RGH6 385 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 PEX12O00623 359 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYN3O14994 580 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSPAN3O60637 253 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 SGPL1O95470 568 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 TUBB4AP04350 444 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 POLBP06746 335 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 TNNT1P13805 278 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 CPA1P15085 419 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 TFEBP19484 476 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRPH2P23942 346 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 EPHB2P29323 1055 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 SOX2P48431 317 aa3□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms