RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 C10orf25Q5T742 122 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 ERAP2Q6P179 960 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 SHC4Q6S5L8 630 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 RRAGAQ7L523 313 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 RAB11FIP2Q7L804 512 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 PIP4P1Q86T03 277 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR52N4Q8NGI2 321 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 C16orf52Q8NHV5 167 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 BCAS4Q8TDM0 211 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZFPM2Q8WW38 1151 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATP2A3Q93084 1043 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 SFXN1Q9H9B4 322 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 H0Y3Z8 333 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPEF2O14830 753 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 UGDHO60701 494 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 NBNO60934 754 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 TCEA3O75764 348 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 FGBP02675 491 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 WNT1P04628 370 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRF1P14222 555 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 TFEBP19484 476 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 TGM2P21980 687 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 SERPINA4P29622 427 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 RCAN1P53805 252 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRKAA2P54646 552 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 B4GALNT1Q00973 533 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 RPS6KA2Q15349 733 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 PXDC1Q5TGL8 231 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 LIPMQ5VYY2 423 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM88Q6PEY1 159 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF793Q6ZN11 406 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM57BQ71RH2 274 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 RTL10Q7L3V2 364 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 MDGA2Q7Z553 956 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 NANOGP1Q8N7R0 232 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC2A12Q8TD20 617 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 PIGOQ8TEQ8 1089 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 CPT1BQ92523 772 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 KAT2BQ92831 832 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 C3orf49Q96BT1 292 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 NPAS1Q99742 590 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 PIMREGQ9BSJ6 248 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 HTATIP2Q9BUP3 242 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 ERVK-5Q9HDB9 667 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 TXNRD2Q9NNW7 524 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM45AQ9NWC5 275 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 ELOVL5Q9NYP7 299 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 HEY2Q9UBP5 337 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 KCND3Q9UK17 655 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 RCE1Q9Y256 329 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 LMTK3Q96Q04 1460 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 A0A0G2JK05 382 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 HMX3A6NHT5 357 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 USP12O75317 370 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 CST5P28325 142 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 GRK6P43250 576 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 MTX1Q13505 466 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 DCTN1Q14203 1278 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 POSTNQ15063 836 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 GRAMD1BQ3KR37 738 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 TBRG1Q3YBR2 411 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 MIDNQ504T8 468 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADGRF4Q8IZF3 695 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 NRACQ8N912 160 aa2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms