RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 VPS16Q9H269 839 aa7.94□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 GANQ9H2C0 597 aa7.94□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 PDCL3Q9H2J4 239 aa7.94□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa7.94□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 CD93Q9NPY3 652 aa7.94□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 RXFP3Q9NSD7 469 aa7.94□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 FANCLQ9NW38 375 aa7.94□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 DDIT4Q9NX09 232 aa7.94□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 COX16Q9P0S2 106 aa7.94□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 STIM2Q9P246 746 aa7.94□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 GON4LQ3T8J9 2241 aa7.94□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 NBEAQ8NFP9 2946 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 LGALS16A8MUM7 142 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 KCNU1A8MYU2 1149 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 PATE3B3GLJ2 98 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 F5H5T6 163 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 LSM8O95777 96 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 DLDP09622 509 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC172P0C7W6 258 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 SLC2A3P11169 496 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 HLA-EP13747 358 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF18P17022 549 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 TACR2P21452 398 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 ITPKAP23677 461 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 CCR1P32246 355 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 DPP6P42658 865 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 KLK7P49862 253 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 COPAP53621 1224 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 SLC6A3Q01959 620 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 CDH18Q13634 790 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 MBLAC2Q68D91 279 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 IL31Q6EBC2 164 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 LRSAM1Q6UWE0 723 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 SLC26A9Q7LBE3 791 aa7.93□□□□□ -1.14
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SGMS1-201ENST00000361543 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 SYT12Q8IV01 421 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 LGI2Q8N0V4 545 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 CFAP52Q8N1V2 620 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 CARNMT1Q8N4J0 409 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF366Q8N895 744 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM35BQ8NCS4 154 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 FIBINQ8TAL6 211 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 EPS8L1Q8TE68 723 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 RNF34Q969K3 372 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 STK33Q9BYT3 514 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 TSPY26PQ9H489 355 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
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SGMS1-201ENST00000361543 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 PLA2G4CQ9UP65 541 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 PLXNA2O75051 1894 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 ACACBO00763 2458 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 ZFHX4Q86UP3 3567 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 NUMA1Q14980 2115 aa7.93□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 DSPP15924 2871 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM131Q92545 1883 aa7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 ITPR1Q14643 2758 aa7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 FAM170AA1A519 330 aa7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 H0Y626 953 aa7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 CBFA2T2O43439 604 aa7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFS2O75306 463 aa7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 GFPT2O94808 682 aa7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 SERPINC1P01008 464 aa7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 ACADMP11310 421 aa7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 ABCB4P21439 1286 aa7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 CD6P30203 668 aa7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 NOS2P35228 1153 aa7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 HOXD12P35452 270 aa7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 CSKP41240 450 aa7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 MATKP42679 507 aa7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 GABRB2P47870 512 aa7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 TPMTP51580 245 aa7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 COPB1P53618 953 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 JAM2P57087 298 aa7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 UBXN1Q04323 297 aa7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF33AQ06730 810 aa7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 LMAN2Q12907 356 aa7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 NME3Q13232 169 aa7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 NCAPHQ15003 741 aa7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 PTPRNQ16849 979 aa7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM61Q5EBN2 209 aa7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 PPM1JQ5JR12 505 aa7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 PITRM1Q5JRX3 1037 aa7.92□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 RABGAP1LQ5R372 815 aa7.92□□□□□ -1.14
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