RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 LGI2Q8N0V4 545 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC26Q8TAB7 109 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 ADAM7Q9H2U9 754 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 MPP6Q9NZW5 540 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 ZMYM5Q9UJ78 669 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 CCL26Q9Y258 94 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 LEFTY2O00292 366 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 RAD51CO43502 376 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 SLC6A4P31645 630 aa22.54■■□□□ 1.2
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HOXA4-201ENST00000360046 DR1Q01658 176 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 NOMO1Q15155 1222 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 ADGRF1Q5T601 910 aa22.54■■□□□ 1.2
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HOXA4-201ENST00000360046 ZNF683Q8IZ20 524 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 SH3RF2Q8TEC5 729 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 ZSWIM3Q96MP5 696 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 RUNDC3BQ96NL0 473 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 ZYG11BQ9C0D3 744 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF148Q9UQR1 794 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 C5orf42Q9H799 3197 aa22.53■■□□□ 1.2
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HOXA4-201ENST00000360046 LTBRP36941 435 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 NR2C2P49116 596 aa22.53■■□□□ 1.2
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HOXA4-201ENST00000360046 MAATS1Q7Z4T9 603 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
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HOXA4-201ENST00000360046 PPM1EQ8WY54 764 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
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HOXA4-201ENST00000360046 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 TDP1Q9NUW8 608 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 DTLQ9NZJ0 730 aa22.53■■□□□ 1.2
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HOXA4-201ENST00000360046 PCYOX1Q9UHG3 505 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 H7C0C1 242 aa22.52■■□□□ 1.2
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HOXA4-201ENST00000360046 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 PRAMEF12O95522 483 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 LATS1O95835 1130 aa22.52■■□□□ 1.2
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HOXA4-201ENST00000360046 ATP5OP48047 213 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 IRAK1P51617 712 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
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HOXA4-201ENST00000360046 ARTNQ5T4W7 220 aa22.52■■□□□ 1.2
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HOXA4-201ENST00000360046 NETO2Q8NC67 525 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 SLC35B2Q8TB61 432 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXA4-201ENST00000360046 S1PR5Q9H228 398 aa22.52■■□□□ 1.2
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HOXA4-201ENST00000360046 ECEL1O95672 775 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 UQCRHP07919 91 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 RBP3P10745 1247 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 SLC7A5Q01650 507 aa22.51■■□□□ 1.19
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HOXA4-201ENST00000360046 GPR153Q6NV75 609 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 Q6ZNB5 142 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 GSTA5Q7RTV2 222 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 NPWQ8N729 165 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 ATL2Q8NHH9 583 aa22.51■■□□□ 1.19
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HOXA4-201ENST00000360046 GRK7Q8WTQ7 553 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 MYEOVQ96EZ4 313 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 EPC1Q9H2F5 836 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
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HOXA4-201ENST00000360046 RHOQP17081 205 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 ELF2Q15723 593 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 HTR3DQ70Z44 454 aa22.51■■□□□ 1.19
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HOXA4-201ENST00000360046 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 CFAP52Q8N1V2 620 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 RIPOR3Q96MK2 946 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 C10orf88Q9H8K7 445 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 STOML2Q9UJZ1 356 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF510Q9Y2H8 683 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 TSPAN3O60637 253 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 LMNB2Q03252 620 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXA4-201ENST00000360046 OASLQ15646 514 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
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