RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 HCRTO43612 131 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS3-201ENST00000355530 DAB1O75553 588 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS3-201ENST00000355530 BAG2O95816 211 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS3-201ENST00000355530 MAGEA12P43365 314 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS3-201ENST00000355530 BTKQ06187 659 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS3-201ENST00000355530 CDC16Q13042 620 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS3-201ENST00000355530 FBXO47Q5MNV8 452 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS3-201ENST00000355530 PDPK2PQ6A1A2 396 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS3-201ENST00000355530 ACTRT2Q8TDY3 377 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS3-201ENST00000355530 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
SPNS3-201ENST00000355530 SNX15Q9NRS6 342 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS3-201ENST00000355530 PNPOQ9NVS9 261 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM216Q9P0N5 145 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 ADM5C9JUS6 153 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 PDGFRBP09619 1106 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 SERPINB8P50452 374 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 GLRA4Q5JXX5 417 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 RNF220Q5VTB9 566 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 SLC30A9Q6PML9 568 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 DHDDSQ86SQ9 333 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 SULF1Q8IWU6 871 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 DEFB106AQ8N104 65 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF567Q8N184 647 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 POU5F2Q8N7G0 328 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 SLC2A14Q8TDB8 520 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 SNX25Q9H3E2 840 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 SEPT10Q9P0V9 454 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF195O14628 629 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 MAP3K13O43283 966 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 ERVK-10P10266 1014 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 CPA3P15088 417 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 ERFP50548 548 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 PPM1JQ5JR12 505 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 MARCH8Q5T0T0 291 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 OR6Y1Q8NGX8 325 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF560Q96MR9 790 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 RBBP8Q99708 897 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC28BQ9BUN5 200 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 CEP41Q9BYV8 373 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 VCX3BQ9H321 246 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 CDY2AQ9Y6F7 541 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 CDY1Q9Y6F8 540 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 BUD23O43709 281 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 USP1O94782 785 aa18.69■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 ARRB2P32121 409 aa18.69■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 PPIL2Q13356 520 aa18.69■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 KIZQ2M2Z5 673 aa18.69■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 PGM2L1Q6PCE3 622 aa18.69■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 CCNYQ8ND76 341 aa18.69■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 PPP2R3CQ969Q6 453 aa18.69■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 FAM149B1Q96BN6 582 aa18.69■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 FAM192AQ9GZU8 254 aa18.69■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 PRDM12Q9H4Q4 367 aa18.69■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 CD4P01730 458 aa18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 LYNP07948 512 aa18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 LMO2P25791 158 aa18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 PRDX6P30041 224 aa18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 SPRP35270 261 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 MLH1P40692 756 aa18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 LIMK2P53671 638 aa18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 ITGA9Q13797 1035 aa18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 FSCBQ5H9T9 825 aa18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 RALGPS1Q5JS13 557 aa18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 NOTUMQ6P988 496 aa18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 ALKAL1Q6UXT8 129 aa18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 ATG14Q6ZNE5 492 aa18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 CATSPER4Q7RTX7 472 aa18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 RSPH3Q86UC2 560 aa18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 NME8Q8N427 588 aa18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 LRRC40Q9H9A6 602 aa18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 GDAP2Q9NXN4 497 aa18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 CDH22Q9UJ99 828 aa18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 PLXNB2O15031 1838 aa18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF236Q9UL36 1845 aa18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 KPNA7A9QM74 516 aa18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 PIRO00625 290 aa18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 RECQL4O94761 1208 aa18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 PNPLA4P41247 253 aa18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 ADIGQ0VDE8 80 aa18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
SPNS3-201ENST00000355530 DPYSQ14117 519 aa18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms