RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 ATP6V1E2Q96A05 226 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 OTUB2Q96DC9 234 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CXorf40BQ96DE9 158 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SLC46A2Q9BY10 475 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TNKS2Q9H2K2 1166 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SPHK2Q9NRA0 654 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 KLHL11Q9NVR0 708 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 C2orf78A6NCI8 922 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TGFB1I1O43294 461 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 HCRTO43612 131 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 URI1O94763 535 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 HNF1BP35680 557 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MAPK10P53779 464 aa4.57□□□□□ -1.68
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PTPRC-201ENST00000348564 MARC1Q5VT66 337 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SYCE2Q6PIF2 218 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SYCE1Q8N0S2 351 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SHKBP1Q8TBC3 707 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 HDAC7Q8WUI4 952 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PSMG2Q969U7 264 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PDLIM2Q96JY6 352 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CAPZA3Q96KX2 299 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 AGPAT1Q99943 283 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
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PTPRC-201ENST00000348564 CWH43Q9H720 699 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 LTB4R2Q9NPC1 389 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MPP6Q9NZW5 540 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 IP6K2Q9UHH9 426 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ATG2BQ96BY7 2078 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 E5RI56 91 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 KDM1AO60341 852 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SDC3O75056 442 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SEC24AO95486 1093 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CALCAP01258 141 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC175P0C221 793 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 UCHL3P15374 230 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CASP14P31944 242 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 RBL2Q08999 1139 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SNX1Q13596 522 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC55Q6ZSA7 311 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 IPMKQ8NFU5 416 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 LMX1AQ8TE12 382 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 IQCDQ96DY2 449 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 FOPNLQ96NB1 174 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 STK33Q9BYT3 514 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MAGEB5Q9BZ81 275 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 HSD3B7Q9H2F3 369 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM9BQ9NQ34 198 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CEP72Q9P209 647 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MYO18BQ8IUG5 2567 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 E2F8A0AVK6 867 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 C4orf47A7E2U8 309 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MTA2O94776 668 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SYF2O95926 243 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 JCHAINP01591 159 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ASLP04424 464 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PAEPP09466 180 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 FGFR3P22607 806 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 GJA4P35212 333 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PDE1BQ01064 536 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 BMT2Q1RMZ1 405 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF542PQ5EBM4 170 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TEX35Q5T0J7 233 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 BROXQ5VW32 411 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 FBXW10Q5XX13 1052 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CRTC1Q6UUV9 634 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CAPN12Q6ZSI9 719 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 HFE2Q6ZVN8 426 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 NT5DC3Q86UY8 548 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZSCAN30Q86W11 494 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 IRF2BP1Q8IU81 584 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 DCLK2Q8N568 766 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 LPCAT1Q8NF37 534 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 OR10T2Q8NGX3 314 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 LINC01599Q8WXQ3 324 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 FGF14Q92915 247 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
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