RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAJC9Q8WXX5 260 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 MFSD14AQ96MC6 490 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR20Q99678 358 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 TAS2R14Q9NYV8 317 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 RASSF10A6NK89 507 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM114B3SHH9 223 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 MAPK8P45983 427 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 PLCL1Q15111 1095 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 NR6A1Q15406 480 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 GRAMD4Q6IC98 578 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 PALB2Q86YC2 1186 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXO39Q8N4B4 442 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 YDJCA8MPS7 323 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 PDZK1P1A8MUH7 402 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 DYRK3O43781 588 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 CHKAP35790 457 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 FMO1Q01740 532 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 SPDYCQ5MJ68 293 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 STK40Q8N2I9 435 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 GALNT4Q8N4A0 578 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 TOP6BLQ8N6T0 577 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 APOPT1Q96IL0 206 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 SCN3BQ9NY72 215 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 MAP3K13O43283 966 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 CALB2P22676 271 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 PEX5P50542 639 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 NFYCQ13952 458 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 CYP51A1Q16850 503 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 HSDL1Q3SXM5 330 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 MCOLN3Q8TDD5 553 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 IL22Q9GZX6 179 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 ACP6Q9NPH0 428 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 NCANO14594 1321 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 ERBB2P04626 1255 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 CCL23P55773 120 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 NOMO3P69849 1222 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXW10Q5XX13 1052 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKS6Q68DC2 871 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 POLNQ7Z5Q5 900 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 BAP1Q92560 729 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 CAMKK2Q96RR4 588 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 RNPEPQ9H4A4 650 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 AHSPQ9NZD4 102 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 UBDO15205 165 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 ALBP02768 609 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 HSPA13P48723 471 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 CDK7P50613 346 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 DAB2P98082 770 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 CHRNB3Q05901 458 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 MYLPFQ96A32 169 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 NFKBIZQ9BYH8 718 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 YIPF3Q9GZM5 350 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 CHADO15335 359 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 FIBCD1Q8N539 461 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 C4orf32Q8N8J7 132 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 TADA1Q96BN2 335 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 NDEL1Q9GZM8 345 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 ASAH2Q9NR71 780 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A0B4J269 797 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 HDCP19113 662 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 TEX9Q8N6V9 391 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 SUSD6Q92537 303 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 GDF3Q9NR23 364 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 ETNK2Q9NVF9 386 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 V9GYQ6 96 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 BTBD19C9JJ37 291 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 ADH1AP07327 375 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 RASA2Q15283 850 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 USP45Q70EL2 814 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 SYTL1Q8IYJ3 562 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF670Q9BS34 389 aa16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms