RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343217.6

DUSP28-201, Transcript of dual specificity phosphatase 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene DUSP28, Length 1,555 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28-201ENST00000343217 WNT16Q9UBV4 365 aa21.53■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa21.53■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 CDH7Q9ULB5 785 aa21.53■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 ASB3Q9Y575 518 aa21.53■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 DRG2P55039 364 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 TWF1Q12792 350 aa21.52■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 MTA1Q13330 715 aa21.52■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 SLC35B2Q8TB61 432 aa21.52■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 P3H4Q92791 437 aa21.52■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 CCDC114Q96M63 670 aa21.52■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 PHOX2BQ99453 314 aa21.52■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 OSBPL2Q9H1P3 480 aa21.52■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 FAM114A2Q9NRY5 505 aa21.52■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
DUSP28-201ENST00000343217 MCF2LO15068 1137 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 ITGAVP06756 1048 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 SRFP11831 508 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 NR2C2P49116 596 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 SEMA3BQ13214 749 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 PPP1R7Q15435 360 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 PYROXD2Q8N2H3 581 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 PQLC3Q8N755 202 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 PLD5Q8N7P1 536 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 ITFG1Q8TB96 612 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 FGF13Q92913 245 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 PSMG2Q969U7 264 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 EPAS1Q99814 870 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 FBXL21Q9UKT6 434 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 DNPEPQ9ULA0 475 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 NUMBLQ9Y6R0 609 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 GOT1P17174 413 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 HTR7P34969 479 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 CLCN6P51797 869 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 EFEMP1Q12805 493 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 NOMO1Q15155 1222 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 OASLQ15646 514 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 C10orf120Q5SQS8 335 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 KLHDC10Q6PID8 442 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 SIX5Q8N196 739 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 CCHCR1Q8TD31 782 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 HAUS1Q96CS2 278 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 SLC39A13Q96H72 371 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 ARFGAP3Q9NP61 516 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 MARCH2Q9P0N8 246 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 ZNF148Q9UQR1 794 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 CREB3O43889 395 aa21.49■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 TLR5O60602 858 aa21.49■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 AOC1P19801 751 aa21.49■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 TUBP50607 506 aa21.49■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 TBX4P57082 545 aa21.49■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 DUPD1Q68J44 220 aa21.49■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 TMCO3Q6UWJ1 677 aa21.49■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 RFX8Q6ZV50 586 aa21.49■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 FLCNQ8NFG4 579 aa21.49■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 TRIM51Q9BSJ1 452 aa21.49■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 OR12D3Q9UGF7 316 aa21.49■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa21.49■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 NUDT5Q9UKK9 219 aa21.49■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 USP34Q70CQ2 3546 aa21.49■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 KRBA1A5PL33 1030 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 ZNF840PA6NDX5 716 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 KCNU1A8MYU2 1149 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 I6L893 689 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 MSI1O43347 362 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 APOEP02649 317 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 LRG1P02750 347 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 TPI1P60174 286 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 RING1Q06587 406 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 PTK6Q13882 451 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 HECTD3Q5T447 861 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 PARM1Q6UWI2 310 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 CCDC89Q8N998 374 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 FGF14Q92915 247 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 FAM118BQ9BPY3 351 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 MAGEB5Q9BZ81 275 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 ANLNQ9NQW6 1124 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 ARHGEF4Q9NR80 690 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 MYO15AQ9UKN7 3530 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 DAPK3O43293 454 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
DUSP28-201ENST00000343217 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms