RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000333467.3

APOBEC3B-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3B, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3B, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3B-201ENST00000333467 PYGMP11217 842 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 UNGP13051 313 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 ASPAP45381 313 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 RPL21P46778 160 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 LMNB2Q03252 620 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 USP4Q13107 963 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 ORC1Q13415 861 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 FZD5Q13467 585 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 PTK6Q13882 451 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 ITIH4Q14624 930 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 PPP1R7Q15435 360 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 TXNDC11Q6PKC3 985 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 FAM35AQ86V20 835 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 PACS2Q86VP3 889 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 MON1AQ86VX9 555 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 RELL1Q8IUW5 271 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 RAPGEF5Q92565 580 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 SEMA4DQ92854 862 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 CABS1Q96KC9 395 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 CEP295NLQ96MC4 621 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 SERPINB12Q96P63 405 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 PLCD4Q9BRC7 762 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 B3GNT5Q9BYG0 378 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 TRIM31Q9BZY9 425 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 CHRDQ9H2X0 955 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 EPB41L4BQ9H329 900 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 KDM4CQ9H3R0 1056 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 TDP1Q9NUW8 608 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 SOBPA7XYQ1 873 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 P4HA1P13674 534 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 LIG3P49916 1009 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 NOP14P78316 857 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 MTAPQ13126 283 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 ZNF77Q15935 545 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 SGO2Q562F6 1265 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 TRIM68Q6AZZ1 485 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 C1orf228Q6PIY5 440 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 CPLX4Q7Z7G2 160 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 MCOLN2Q8IZK6 566 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 TTC16Q8NEE8 873 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 TAS1R2Q8TE23 839 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 SNF8Q96H20 258 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 C8orf48Q96LL4 319 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 TTLL2Q9BWV7 592 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 IMPG2Q9BZV3 1241 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 HPS4Q9NQG7 708 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 KRT82Q9NSB4 513 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 MYOFQ9NZM1 2061 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 RASGRF2O14827 1237 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 GSTA1P08263 222 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 USP17L7P0C7H9 530 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 RARAP10276 462 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 KRT5P13647 590 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 CCDC130P13994 396 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 NSFP46459 744 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 SEC24CP53992 1094 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 SLC29A2Q14542 456 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 ICE2Q659A1 982 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 TTC27Q6P3X3 843 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 ACOT1Q86TX2 421 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 CCDC89Q8N998 374 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 ATL2Q8NHH9 583 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 SMARCD1Q96GM5 515 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 SEC16BQ96JE7 1060 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 TNIP3Q96KP6 325 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 CYP2S1Q96SQ9 504 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 FAM83CQ9BQN1 747 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 MED10Q9BTT4 135 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 EBF3Q9H4W6 596 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 PPCSQ9HAB8 311 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 ANAPC7Q9UJX3 599 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 FBXO4Q9UKT5 387 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 CNTN6Q9UQ52 1028 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 ZNF292O60281 2723 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 PROSCO94903 275 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3B-201ENST00000333467 CHRNB1P11230 501 aa11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms