RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 FLRT2O43155 660 aa21.89■■□□□ 1.09
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SOCS1-201ENST00000332029 BEND5Q7L4P6 421 aa21.87■■□□□ 1.09
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SOCS1-201ENST00000332029 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
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SOCS1-201ENST00000332029 RPS24P62847 133 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
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SOCS1-201ENST00000332029 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SOCS1-201ENST00000332029 USP30Q70CQ3 517 aa21.84■■□□□ 1.09
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