RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 NSFP46459 744 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 IRAK1P51617 712 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 GSCP56915 257 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 MTA1Q13330 715 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 NR1I3Q14994 352 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 BRMS1LQ5PSV4 323 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXL22Q6P050 247 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 EMC1Q8N766 993 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRGPRX1Q96LB2 322 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFAP57Q96MR6 1250 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYT11Q9BT88 431 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 RHOBTB1O94844 696 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 GJB6O95452 261 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 DLDP09622 509 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 HLA-EP13747 358 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 TPM4P67936 248 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 FANCCQ00597 558 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 DEUP1Q05D60 604 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 AUHQ13825 339 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 RABGAP1LQ5R372 815 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 MON1BQ7L1V2 547 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGSF8Q969P0 613 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTC17Q96AE7 1141 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 TKTL2Q9H0I9 626 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM245Q9H330 911 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD93Q9NPY3 652 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEMA4GQ9NTN9 838 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 VANGL2Q9ULK5 521 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1B0GVM2 712 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCAF2A6NFQ2 919 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 H0Y626 953 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 F9P00740 461 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPHX1P07099 455 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC172P0C7W6 258 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSKP41240 450 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSRP2Q16527 193 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 PITRM1Q5JRX3 1037 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 C14orf80Q86SX3 495 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF366Q8N895 744 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 JOSD2Q8TAC2 188 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYO19Q96H55 970 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDCPQ9H6R7 721 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAM22Q9P0K1 906 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEP192Q8TEP8 1941 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 CALB1P05937 261 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 RDXP35241 583 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 MPLP40238 635 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 PBX1P40424 430 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 COPAP53621 1224 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC6Q16204 474 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLEKHG6Q3KR16 790 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 C5orf22Q49AR2 442 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRGPRX3Q96LB0 322 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYP8B1Q9UNU6 501 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLA2G4CQ9UP65 541 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNX10Q9Y5X0 201 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 C2CD4BA6NLJ0 364 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF217O75362 1048 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 ENDOD1O94919 500 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASLP04424 464 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP11AP98196 1134 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 LMNB2Q03252 620 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASIC2Q16515 512 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC14Q49A88 953 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB6CQ53S08 254 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 FIGNQ5HY92 759 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLA2G2CQ5R387 149 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRR23CQ6ZRP0 262 aa20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms