RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 PIF1Q9H611 641 aa16.98■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 PI4KBQ9UBF8 816 aa16.98■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 FAM86B1E9PN63 330 aa16.98■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 PHKA2P46019 1235 aa16.98■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 SEPHS1P49903 392 aa16.98■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 FSTL1Q12841 308 aa16.98■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 PRR5LQ6MZQ0 368 aa16.98■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 SAPCD2Q86UD0 394 aa16.98■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa16.98■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 AP4E1Q9UPM8 1137 aa16.98■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 FDX1P10109 184 aa16.98■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 AVPR1AP37288 418 aa16.98■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 ABCG1P45844 678 aa16.98■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 GSSP48637 474 aa16.98■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 GRAPQ13588 217 aa16.98■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 CYP51A1Q16850 503 aa16.98■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 SLFN12LQ6IEE8 588 aa16.98■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 CES3Q6UWW8 571 aa16.98■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 ISOC1Q96CN7 298 aa16.98■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 RNF38Q9H0F5 515 aa16.98■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 UBDO15205 165 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 CCNKO75909 580 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 GABRB2P47870 512 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 GPX6P59796 221 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 PRKAA1Q13131 559 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 STRA8Q7Z7C7 330 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 VPS39Q96JC1 886 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 FAM84AQ96KN4 292 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 SDR42E2A6NKP2 422 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 VILLO15195 856 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 MTA2O94776 668 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 IDO1P14902 403 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 IDH3AP50213 366 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 IST1P53990 364 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 RALGDSQ12967 914 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 SLC2A7Q6PXP3 512 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 KCTD8Q6ZWB6 473 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 STK32CQ86UX6 486 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 ANKLE1Q8NAG6 615 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 WDR27A2RRH5 827 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 NR5A2O00482 541 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 SLITRK3O94933 977 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 LDLRP01130 860 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 AOC1P19801 751 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 GARTP22102 1010 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 OR8H2Q8N162 312 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 CBR4Q8N4T8 237 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 SLC7A3Q8WY07 619 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 BBS2Q9BXC9 721 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 ACSS2Q9NR19 701 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 SCN3BQ9NY72 215 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 TBX20Q9UMR3 447 aa16.97■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 FAM149AA5PLN7 773 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 CENPXA8MT69 81 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 WDR47O94967 919 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 TSHRP16473 764 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 ALDH1B1P30837 517 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 ARHGDIAP52565 204 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 GAD2Q05329 585 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 DCAKDQ8WVC6 231 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 S100ZQ8WXG8 99 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 RORBQ92753 470 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 STMN3Q9NZ72 180 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 EBF1Q9UH73 591 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 M0R2N6 131 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 FGRP09769 529 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 NAGLUP54802 743 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 HYIQ5T013 277 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 NPNTQ6UXI9 565 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 C1orf186Q6ZWK4 172 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 ZNF696Q9H7X3 374 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 DBNDD1Q9H9R9 158 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 CYP4F12Q9HCS2 524 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 A0A096LPK6 155 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 SLCO1B7G3V0H7 640 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 TSC22D2O75157 780 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 GABBR2O75899 941 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 ZBTB7AO95365 584 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 MOXD1Q6UVY6 613 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 ZNF606Q8WXB4 792 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 EPB41L1Q9H4G0 881 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 POLIQ9UNA4 740 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 ST14Q9Y5Y6 855 aa16.96■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 ROBO3Q96MS0 1386 aa16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms