RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299608.6

TMX3-201, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMX3, Length 4,927 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3-201ENST00000299608 ACAP1Q15027 740 aa10.91□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 NPNTQ6UXI9 565 aa10.91□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 FAM35AQ86V20 835 aa10.91□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 CCDC126Q96EE4 140 aa10.91□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 MAGEB16A2A368 324 aa10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 MGAT4DA6NG13 374 aa10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 SH3BGRLO75368 114 aa10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 FGBP02675 491 aa10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 PHKG1Q16816 387 aa10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 C7orf61Q8IZ16 206 aa10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 CHPFQ8IZ52 775 aa10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 BSNDQ8WZ55 320 aa10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 L2HGDHQ9H9P8 463 aa10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 CNTNAP1P78357 1384 aa10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 ADGRB2O60241 1585 aa10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 IRAK1P51617 712 aa10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 CCL14Q16627 93 aa10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 DNAL1Q4LDG9 190 aa10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 LONP2Q86WA8 852 aa10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 LRRC34Q8IZ02 419 aa10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 MAB21L3Q8N8X9 362 aa10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 SDK1Q7Z5N4 2213 aa10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 CFAP73A6NFT4 308 aa10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 IL1BP01584 269 aa10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 CYTH1Q15438 398 aa10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 C9orf57Q5W0N0 161 aa10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 NAT16Q8N8M0 369 aa10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 SERAC1Q96JX3 654 aa10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa10.9□□□□□ -0.66
TMX3-201ENST00000299608 PIRTP0C851 137 aa10.9□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 TPBGLP0DKB5 382 aa10.9□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 HLA-DPA1P20036 260 aa10.9□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 SERPINB5P36952 375 aa10.9□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 GP5P40197 560 aa10.9□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 RPL21P46778 160 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 PLK1P53350 603 aa10.9□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 DBF4BQ8NFT6 615 aa10.9□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 CLEC4DQ8WXI8 215 aa10.9□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 EME1Q96AY2 570 aa10.9□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 PLEKHA8Q96JA3 519 aa10.9□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 MYOCQ99972 504 aa10.9□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 B3GNT5Q9BYG0 378 aa10.9□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 PRKD2Q9BZL6 878 aa10.9□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP10.9□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 ADNPQ9H2P0 1102 aa10.9□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 RAD18Q9NS91 495 aa10.9□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 TAS2R13Q9NYV9 303 aa10.9□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 FAM50BQ9Y247 325 aa10.9□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 ZNF862O60290 1169 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 GLUD2P49448 558 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 NUDT2P50583 147 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 NCALDP61601 193 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 FMO1Q01740 532 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 NR6A1Q15406 480 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 MIIPQ5JXC2 388 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 PRR23CQ6ZRP0 262 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 MIER2Q8N344 545 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 PRDM12Q9H4Q4 367 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 BCL9LQ86UU0 1499 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 UBR1Q8IWV7 1749 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 FZD9O00144 591 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 AOC2O75106 756 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 CD86P42081 329 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 PSEN1P49768 467 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 CRADDP78560 199 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 MMRN1Q13201 1228 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 XRCC4Q13426 336 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 PWP1Q13610 501 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 C16orf89Q6UX73 402 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 ZNF384Q8TF68 577 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 HDAC7Q8WUI4 952 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 TBL1YQ9BQ87 522 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 ZNF556Q9HAH1 456 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 HEY2Q9UBP5 337 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 PHTF1Q9UMS5 762 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 PJA2O43164 708 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 PSMB4P28070 264 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 FMO4P31512 558 aa10.89□□□□□ -0.67
TMX3-201ENST00000299608 PRKCIP41743 596 aa10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms