RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297316.4

SOX17-201, Transcript of SRY-box 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOX17, Length 2,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17-201ENST00000297316 KIAA1841Q6NSI8 718 aa21.97■■□□□ 1.11
SOX17-201ENST00000297316 ZNF534Q76KX8 674 aa21.97■■□□□ 1.11
SOX17-201ENST00000297316 PALM2Q8IXS6 379 aa21.97■■□□□ 1.11
SOX17-201ENST00000297316 HTR3CQ8WXA8 447 aa21.97■■□□□ 1.11
SOX17-201ENST00000297316 IL37Q9NZH6 218 aa21.97■■□□□ 1.11
SOX17-201ENST00000297316 C5orf60A6NFR6 353 aa21.97■■□□□ 1.11
SOX17-201ENST00000297316 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SOX17-201ENST00000297316 AUTS2Q8WXX7 1259 aa21.97■■□□□ 1.11
SOX17-201ENST00000297316 CLSTN3Q9BQT9 956 aa21.97■■□□□ 1.11
SOX17-201ENST00000297316 TRIM62Q9BVG3 475 aa21.97■■□□□ 1.11
SOX17-201ENST00000297316 ACSS3Q9H6R3 686 aa21.97■■□□□ 1.11
SOX17-201ENST00000297316 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa21.97■■□□□ 1.11
SOX17-201ENST00000297316 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SOX17-201ENST00000297316 KIAA1671Q9BY89 1806 aa21.97■■□□□ 1.11
SOX17-201ENST00000297316 EBAG9O00559 213 aa21.96■■□□□ 1.11
SOX17-201ENST00000297316 PAGE1O75459 146 aa21.96■■□□□ 1.11
SOX17-201ENST00000297316 EPHB2P29323 1055 aa21.96■■□□□ 1.11
SOX17-201ENST00000297316 GRIA1P42261 906 aa21.96■■□□□ 1.11
SOX17-201ENST00000297316 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SOX17-201ENST00000297316 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SOX17-201ENST00000297316 SLC8B1Q6J4K2 584 aa21.96■■□□□ 1.11
SOX17-201ENST00000297316 CHMP6Q96FZ7 201 aa21.96■■□□□ 1.11
SOX17-201ENST00000297316 PRDM12Q9H4Q4 367 aa21.96■■□□□ 1.11
SOX17-201ENST00000297316 PLAC1Q9HBJ0 212 aa21.96■■□□□ 1.11
SOX17-201ENST00000297316 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SOX17-201ENST00000297316 AP1B1Q10567 949 aa21.96■■□□□ 1.11
SOX17-201ENST00000297316 A0A1W2PPM1 405 aa21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 PHBP35232 272 aa21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 EFEMP1Q12805 493 aa21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 VPS52Q8N1B4 723 aa21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 SLC39A11Q8N1S5 342 aa21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 CCNYQ8ND76 341 aa21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 P2RY11Q96G91 374 aa21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 ZNF558Q96NG5 402 aa21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 DHRS4Q9BTZ2 278 aa21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 TMEM106CQ9BVX2 250 aa21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 CCDC134Q9H6E4 229 aa21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 SLC24A2Q9UI40 661 aa21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 NEU3Q9UQ49 428 aa21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 LAMA3Q16787 3333 aa21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 FAM92AA1XBS5 289 aa21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 HACD1B0YJ81 288 aa21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 SPAG7O75391 227 aa21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 SEC24AO95486 1093 aa21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 PPM1EQ8WY54 764 aa21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 PAFAH2Q99487 392 aa21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 EPAS1Q99814 870 aa21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 SEPT10Q9P0V9 454 aa21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 ACTL7BQ9Y614 415 aa21.95■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 A0A0A0MRY4 1105 aa21.94■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa21.94■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 DNAJB2P25686 324 aa21.94■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 CCR1P32246 355 aa21.94■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 ARTNQ5T4W7 220 aa21.94■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa21.94■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa21.94■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 LRRC34Q8IZ02 419 aa21.94■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 TMEM199Q8N511 208 aa21.94■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 CFAP36Q96G28 342 aa21.94■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 TMEM169Q96HH4 297 aa21.94■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 SPATA13Q96N96 652 aa21.94■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 RNF103O00237 685 aa21.94■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 SOD2P04179 222 aa21.94■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 HCAR3P49019 387 aa21.94■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 CBLBQ13191 982 aa21.94■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 MIB1Q86YT6 1006 aa21.94■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 C4orf33Q8N1A6 199 aa21.94■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 MPP5Q8N3R9 675 aa21.94■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa21.94■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 GDAP1Q8TB36 358 aa21.94■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 DCAKDQ8WVC6 231 aa21.94■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 SPATA17Q96L03 361 aa21.94■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 ALPK3Q96L96 1907 aa21.93■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 SLC38A8A6NNN8 435 aa21.93■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 C1QAP02745 245 aa21.93■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 KRT15P19012 456 aa21.93■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 EN2P19622 333 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 MAGEA3P43357 314 aa21.93■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 WASHC5Q12768 1159 aa21.93■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 SEMA5AQ13591 1074 aa21.93■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 C14orf80Q86SX3 495 aa21.93■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 PACS2Q86VP3 889 aa21.93■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 MCUQ8NE86 351 aa21.93■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 OSBPL2Q9H1P3 480 aa21.93■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 TRABDQ9H4I3 376 aa21.93■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 CCSER2Q9H7U1 834 aa21.93■■□□□ 1.1
SOX17-201ENST00000297316 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms