RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 TBL1YQ9BQ87 522 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 NCANO14594 1321 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM24O15164 1050 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ABHD2P08910 425 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 PURAQ00577 322 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM26Q6ZUK4 368 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 FAM126BQ8IXS8 530 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 CDRT15Q96T59 188 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 UGT2B28Q9BY64 529 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 MYRFQ9Y2G1 1151 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 SIGLEC16A6NMB1 481 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 TTLL13PA6NNM8 815 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 BCL10O95999 233 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF286BP0CG31 522 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.043e-6■□□□□ 8.2
CCSAP-201ENST00000284617 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 CNGA2Q16280 664 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 SETD9Q8NE22 299 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 SLC2A14Q8TDB8 520 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 APBA2Q99767 749 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ENOPH1Q9UHY7 261 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 XRCC4Q13426 336 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 C9orf16Q9BUW7 83 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 PDZK1P1A8MUH7 402 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 MEI4A8MW99 385 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 E5RJQ4 531 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ETS1P14921 441 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 EPHB3P54753 998 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 AUHQ13825 339 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ELOVL4Q9GZR5 314 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 POPDC2Q9HBU9 364 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 GAKO14976 1311 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 HASPINQ8TF76 798 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 FIG4Q92562 907 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ETNK2Q9NVF9 386 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 AHSPQ9NZD4 102 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 A0A087X1B8 175 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 HOXC6P09630 235 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 CYP2A7P20853 494 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 RXRGP48443 463 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 RAB14P61106 215 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF398Q8TD17 642 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC19Q9H756 370 aa21.56■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC154A6NI56 674 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 CXCL11O14625 94 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 FOXR2Q6PJQ5 311 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 SLC9A9Q8IVB4 645 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 METTL6Q8TCB7 284 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 MIEF1Q9NQG6 463 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF446Q9NWS9 450 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 PADI4Q9UM07 663 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 MSH3P20585 1137 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 PPP2R1BP30154 601 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 OR1E1P30953 314 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 RPL14P50914 215 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 GTF2BQ00403 316 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 PACS2Q86VP3 889 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 PORCNQ9H237 461 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM150BA6NC51 233 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ALDH2P05091 517 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 PCNAP12004 261 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 MAMLD1Q13495 774 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 FAM71AQ8IYT1 594 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 FAM220BPB1ANY3 271 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 PROCP04070 461 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 PSMB9P28065 219 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 MKL1Q969V6 931 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL25Q9H0H3 589 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ADAM30Q9UKF2 790 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 AP3M1Q9Y2T2 418 aa21.55■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF862O60290 1169 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 NUDT17P0C025 328 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 RPS7P62081 194 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 TGM3Q08188 693 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms