RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 ITGALP20701 1170 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CXCR2P25025 360 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PDK4Q16654 411 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 LY6KQ17RY6 165 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 WLSQ5T9L3 541 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 FAM92BQ6ZTR7 304 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 SLC24A5Q71RS6 500 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 RELL1Q8IUW5 271 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CDH19Q9H159 772 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PLA2G4CQ9UP65 541 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 C5orf60A6NFR6 353 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 LACTBL1A8MY62 500 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 EML1O00423 815 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 RAD51BO15315 384 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 DAB1O75553 588 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 IGSF6O95976 241 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 OR56A5P0C7T3 313 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CDC25CP30307 473 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CLCN5P51795 746 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CRYMQ14894 314 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ICE2Q659A1 982 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 RTL10Q7L3V2 364 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 SPDL1Q96EA4 605 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 GPR20Q99678 358 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 SPON2Q9BUD6 331 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ESYT3A0FGR9 886 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 VGLL3A8MV65 326 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 DDNO94850 711 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 SERPINA4P29622 427 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 OR1E1P30953 314 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PNLIPRP1P54315 467 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 POU4F1Q01851 419 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 SLC26A9Q7LBE3 791 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 TCAIMQ8N3R3 496 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa6.48□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PHIPQ8WWQ0 1821 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ESRRBO95718 433 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 FGF1P05230 155 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ARPP19P56211 112 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 IL17AQ16552 155 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 BTN2A3PQ96KV6 586 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 TCF12Q99081 682 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PAFAH2Q99487 392 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 HCAR3P49019 387 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 FMO1Q01740 532 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ACCSLQ4AC99 568 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PAGE2BQ5JRK9 111 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 TRIM69Q86WT6 500 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 FAM71DQ8N9W8 422 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 AP4S1Q9Y587 144 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 E2F6O75461 281 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 BHLHB9Q6PI77 547 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 TBC1D4O60343 1298 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 VTNP04004 478 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 DGKAP23743 735 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 KLK7P49862 253 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 C9orf57Q5W0N0 161 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 KCNMB4Q86W47 210 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 NTAN1Q96AB6 310 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 FAM50BQ9Y247 325 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 STYXL1Q9Y6J8 313 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 UBR3Q6ZT12 1888 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CILPO75339 1184 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 NFKB1P19838 968 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 MIPP30301 263 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 AVPR1AP37288 418 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PCYT1AP49585 367 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PTPROQ16827 1216 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 SYCP2LQ5T4T6 812 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 BEND5Q7L4P6 421 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 TMEM121Q9BTD3 319 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 UGT2B28Q9BY64 529 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 KRT6AP02538 564 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 KRT6BP04259 564 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 KRT6CP48668 564 aa6.47□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 USP41Q3LFD5 358 aa6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms