RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006015.3

HOXA11-201, Transcript of homeobox A11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA11, Length 2,295 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11-201ENST00000006015 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 TRPC4APQ8TEL6 797 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 NLRP7Q8WX94 980 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 OTUD5Q96G74 571 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 SIGLEC10Q96LC7 697 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 PHF12Q96QT6 1004 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 PLGRKTQ9HBL7 147 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 WDR37Q9Y2I8 494 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 SQORQ9Y6N5 450 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 ENDOD1O94919 500 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 ZBED1O96006 694 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 PIGRP01833 764 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 GJB1P08034 283 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 CDH6P55285 790 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 HSDL1Q3SXM5 330 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 POTEHQ6S545 545 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 ATG14Q6ZNE5 492 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 SLC4A11Q8NBS3 891 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 CCT7Q99832 543 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 TCHPQ9BT92 498 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 CDY2AQ9Y6F7 541 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 CDY1Q9Y6F8 540 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 TPP1O14773 563 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 THRAP10827 490 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 RALBP11234 206 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 ALDH3B2P48448 385 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 AP3M2P53677 418 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 EPGNQ6UW88 154 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 PACS1Q6VY07 963 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 LPCAT2Q7L5N7 544 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 LILRA2Q8N149 483 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 TRIML2Q8N7C3 387 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 TJP2Q9UDY2 1190 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 ADGRA2Q96PE1 1338 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 SUPT3HO75486 399 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 VARSP26640 1264 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 ARRB2P32121 409 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 THOP1P52888 689 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 PHEXP78562 749 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF423Q2M1K9 1284 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 C4orf22Q6V702 233 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 CYS1Q717R9 158 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 TMEM130Q8N3G9 435 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 GALNT4Q8N4A0 578 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 KYQ8NBH2 561 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 LHX5Q9H2C1 402 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 MOCS1Q9NZB8 636 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 COPG2Q9UBF2 871 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 KLHL41O60662 606 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 RBL1P28749 1068 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 NUMBP49757 651 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 TMEM62Q0P6H9 643 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 INSCQ1MX18 579 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 PIGGQ5H8A4 983 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF534Q76KX8 674 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 XYLT1Q86Y38 959 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 PKP2Q99959 881 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 CDH19Q9H159 772 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 COG4Q9H9E3 785 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 NRBP2Q9NSY0 501 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 ASNSD1Q9NWL6 643 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 PACSIN3Q9UKS6 424 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 SIP14410 1827 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 AIM2O14862 343 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 IDO1P14902 403 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 MPP5Q8N3R9 675 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 KCNN1Q92952 543 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 PEBP4Q96S96 227 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 CSADQ9Y600 493 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 H0YJX3 145 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 GPR25O00155 361 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 CBFA2T3O75081 653 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 TPSB2P20231 275 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 MX2P20592 715 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 TGM2P21980 687 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 EDNRBP24530 442 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 YY1P25490 414 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 NUP107P57740 925 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 OSTNP61366 133 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA11-201ENST00000006015 TPSAB1Q15661 275 aa20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms