RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641340.1

MFSD8-223, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 2,098 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-223	ENST00000641340	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CES4A	Q5XG92	561 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CERS5	Q8N5B7	392 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	MR1	Q95460	341 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	LRRC46	Q96FV0	321 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	SLC35A4	Q96G79	324 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	WDR18	Q9BV38	432 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ANO3	Q9BYT9	981 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	COA1	Q9GZY4	146 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CBLC	Q9ULV8	474 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ZMYM6	O95789	1325 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	SIPA1L1	O43166	1804 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340		E7EWF7	191 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	C2CD2L	O14523	706 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	VEGFD	O43915	354 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	YEATS4	O95619	227 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CAPN2	P17655	700 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CD33	P20138	364 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	HERVK_113	P62684	666 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ERVK-24	P63145	666 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	FAM189B	P81408	668 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ITGA7	Q13683	1181 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	FGL2	Q14314	439 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	AOC3	Q16853	763 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	C12orf60	Q5U649	245 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ADAL	Q6DHV7	355 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CENPP	Q6IPU0	288 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	RRAGA	Q7L523	313 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ADCK1	Q86TW2	530 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	DHX58	Q96C10	678 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	EID2B	Q96D98	161 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	FAM84A	Q96KN4	292 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CCDC140	Q96MF4	163 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	VPS16	Q9H269	839 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	DPH5	Q9H2P9	285 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	MUC13	Q9H3R2	512 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	UTRN	P46939	3433 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	MYH6	P13533	1939 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	TCHH	Q07283	1943 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	SMIM22	K7EJ46	135 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	TP73	O15350	636 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ECE2	O60344	883 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	7.24	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CLEC3A	O75596	197 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	F9	P00740	461 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ZNF24	P17028	368 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	PITPNB	P48739	271 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	DSC2	Q02487	901 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	PCDH1	Q08174	1060 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	PDK1	Q15118	436 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ALX1	Q15699	326 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	BAK1	Q16611	211 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		7.24	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	TMX3	Q96JJ7	454 aa		7.24	□□□□□ -1.25

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