RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636621.1

LINC00598-211, long intergenic non-protein coding RNA 598, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC00598, Length 3,241 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00598-211ENST00000636621 GLDCP23378 1020 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 GSTT1P30711 240 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 GRIA1P42261 906 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 LY6KQ17RY6 165 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SYCP2LQ5T4T6 812 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 UGT2A3Q6UWM9 527 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 UNC93AQ86WB7 457 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 TICAM1Q8IUC6 712 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 MARVELD2Q8N4S9 558 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 NT5C3BQ969T7 300 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 RILPQ96NA2 401 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 CPNE1Q99829 537 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 CENPKQ9BS16 269 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF385DQ9H6B1 395 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 NDUFA13Q9P0J0 144 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 IGSF9Q9P2J2 1179 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ATP9BO43861 1147 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 DNAJB1P25685 340 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 PHKA2P46019 1235 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SLC25A3Q00325 362 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SFT2D3Q587I9 215 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 GRTP1Q5TC63 336 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 POTEAQ6S8J7 498 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 LIMS2Q7Z4I7 341 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 LCA5Q86VQ0 697 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 C10orf107Q8IVU9 208 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 MICALL2Q8IY33 904 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 DTNBP1Q96EV8 351 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 GBP5Q96PP8 586 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 CAMKK2Q96RR4 588 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 GORASP1Q9BQQ3 440 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 PLK2Q9NYY3 685 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 NME7Q9Y5B8 376 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 COL1A2P08123 1366 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 WDR27A2RRH5 827 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 FZD9O00144 591 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 VCLP18206 1134 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 GP5P40197 560 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 OSTNP61366 133 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 LSAMPQ13449 338 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SNAPC2Q13487 334 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 MED21Q13503 144 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ZBTB6Q15916 424 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 CDO1Q16878 200 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 RALGPS1Q5JS13 557 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF484Q5JVG2 852 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SPANXN3Q5MJ09 141 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 PDPK2PQ6A1A2 396 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 EFCAB12Q6NXP0 572 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 FRMD7Q6ZUT3 714 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 TMEM135Q86UB9 458 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SHKBP1Q8TBC3 707 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 PPP4R1Q8TF05 950 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 JDP2Q8WYK2 163 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 TTC1Q99614 292 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 TRIM4Q9C037 500 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SPATC1LQ9H0A9 340 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 DPP3Q9NY33 737 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 STK39Q9UEW8 545 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 AP4E1Q9UPM8 1137 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 PSAT1Q9Y617 370 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 RAD54BQ9Y620 910 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 CDY2AQ9Y6F7 541 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 CDY1Q9Y6F8 540 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 MEI4A8MW99 385 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 G3V2L1 256 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 USP1O94782 785 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 MX2P20592 715 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ITGA9Q13797 1035 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 FSCBQ5H9T9 825 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 MDH1BQ5I0G3 518 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 TRIM50Q86XT4 487 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 LRRC52Q8N7C0 313 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 C12orf29Q8N999 325 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 RBBP8Q99708 897 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms