RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 OSER1Q9NX31 292 aa20.62■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 CCL16O15467 120 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 ITGAVP06756 1048 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 NCAM1P13591 858 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 NOS2P35228 1153 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 MATKP42679 507 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 ARSEP51690 589 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 OASLQ15646 514 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 BTBD8Q5XKL5 378 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 C6orf89Q6UWU4 347 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 PRUNE1Q86TP1 453 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 ITIH5Q86UX2 942 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 EXOC3L1Q86VI1 746 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 SEC16BQ96JE7 1060 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 MYRFLQ96LU7 910 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 PWWP2AQ96N64 755 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 IGFLR1Q9H665 355 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 CCDC134Q9H6E4 229 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 ABCC13Q9NSE7 274 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 ASB3Q9Y575 518 aa20.61■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 LRCH4O75427 683 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 CPP00450 1065 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 SDC4P31431 198 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 ATP11AP98196 1134 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 CDO1Q16878 200 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.892e-6■■■■□ 23.2
CLN8-208ENST00000635751 CCDC77Q9BR77 488 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 CNPY3Q9BT09 278 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 ABHD2P08910 425 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 IFT88Q13099 833 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 STAT4Q14765 748 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 GRIN2CQ14957 1233 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 CCDC38Q502W7 563 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 ZNF697Q5TEC3 545 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 RTL10Q7L3V2 364 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 ARHGAP18Q8N392 663 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 ZWILCHQ9H900 591 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 LGALS13Q9UHV8 139 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 NUDT5Q9UKK9 219 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 NOTCH4Q99466 2003 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 DPYSL4O14531 572 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 MAGEA4P43358 317 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 LIG3P49916 1009 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 GPS1Q13098 491 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 MORF4L2Q15014 288 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 ACAP1Q15027 740 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 RAB6CQ53S08 254 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 ELMOD1Q8N336 334 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 GLIS1Q8NBF1 620 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 TTC13Q8NBP0 860 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 PPP2R3CQ969Q6 453 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 HAUS1Q96CS2 278 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 CABS1Q96KC9 395 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 TBCBQ99426 244 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 ADAM33Q9BZ11 813 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 RAB6CQ9H0N0 254 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 DPP7Q9UHL4 492 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 SZT2Q5T011 3432 aa20.58■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 TMEM265A0A087WTH1 108 aa20.58■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa20.58■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 PTPN9P43378 593 aa20.58■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 SULT1E1P49888 294 aa20.58■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 TAZQ16635 292 aa20.58■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 SLC25A52Q3SY17 297 aa20.58■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 TCEAL5Q5H9L2 206 aa20.58■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 HS6ST3Q8IZP7 471 aa20.58■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 MICALL1Q8N3F8 863 aa20.58■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 VN1R2Q8NFZ6 395 aa20.58■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 TTC25Q96NG3 672 aa20.58■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 STAP1Q9ULZ2 295 aa20.58■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 C2orf16Q68DN1 1984 aa20.58■□□□□ 0.89
CLN8-208ENST00000635751 SGK1O00141 431 aa20.57■□□□□ 0.88
CLN8-208ENST00000635751 CDH16O75309 829 aa20.57■□□□□ 0.88
CLN8-208ENST00000635751 RNF8O76064 485 aa20.57■□□□□ 0.88
CLN8-208ENST00000635751 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa20.57■□□□□ 0.88
CLN8-208ENST00000635751 KDELR1P24390 212 aa20.57■□□□□ 0.88
CLN8-208ENST00000635751 IL1R2P27930 398 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms