RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624927.3

LINC01128-215, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1128, human

TSL 5

Gene LINC01128, Length 677 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC01128-215	ENST00000624927	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	MZT2A	Q6P582	158 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	CNTROB	Q8N137	903 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	MAP4K1	Q92918	833 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	VPS50	Q96JG6	964 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	CHST8	Q9H2A9	424 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	PRO3102	Q9H379	93 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	MID2	Q9UJV3	735 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	CCDC7	Q96M83	1385 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	MYMK	A6NI61	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	GOLIM4	O00461	696 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	SNX2	O60749	519 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	ZBED1	O96006	694 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	FAM193A	P78312	1265 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927		A0A1W2PPC1	479 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927		A6NNZ2	444 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	ADRA1D	P25100	572 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	SESTD1	Q86VW0	696 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	JDP2	Q8WYK2	163 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	INSR	P06213	1382 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	AGPS	O00116	658 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	CLIC1	O00299	241 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	ADAM10	O14672	748 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	TPP1	O14773	563 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	INSIG1	O15503	277 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	NTN1	O95631	604 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	MCM5	P33992	734 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	ID2	Q02363	134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	ZNF91	Q05481	1191 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	FHL1	Q13642	323 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	CLCA4	Q14CN2	919 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	CST9	Q5W186	159 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	USP49	Q70CQ1	688 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	DEFB123	Q8N688	67 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	WAC	Q9BTA9	647 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	FZD4	Q9ULV1	537 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	USP47	Q96K76	1375 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	TRIM38	O00635	465 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	TLR2	O60603	784 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC01128-215	ENST00000624927	PIK3C2G	O75747	1445 aa		4.59	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms