RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624145.3

ANKRD28-215, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,383 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-215ENST00000624145 EFR3BQ9Y2G0 817 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 OR10H1Q9Y4A9 318 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 SPEF1Q9Y4P9 236 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 GRIN2AQ12879 1464 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 ANKDD1BA6NHY2 528 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa4.13□□□□□ -1.75
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ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF432O94892 652 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 CHRNGP07510 517 aa4.13□□□□□ -1.75
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ANKRD28-215ENST00000624145 MTTPP55157 894 aa4.13□□□□□ -1.75
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ANKRD28-215ENST00000624145 TBC1D25Q3MII6 688 aa4.13□□□□□ -1.75
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ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF280DQ6N043 979 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 DOK6Q6PKX4 331 aa4.13□□□□□ -1.75
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ANKRD28-215ENST00000624145 MCEMP1Q8IX19 187 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 FBXO36Q8NEA4 188 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 OXER1Q8TDS5 423 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 CAPSLQ8WWF8 208 aa4.13□□□□□ -1.75
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ANKRD28-215ENST00000624145 ANKRD27Q96NW4 1050 aa4.13□□□□□ -1.75
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ANKRD28-215ENST00000624145 CLN6Q9NWW5 311 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 PSME2Q9UL46 239 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 INPP4BO15327 924 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 TEX33O43247 280 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 RAD51CO43502 376 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 TNFAIP8O95379 198 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 IGSF6O95976 241 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 CETPP11597 493 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
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ANKRD28-215ENST00000624145 HSD17B3P37058 310 aa4.12□□□□□ -1.75
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ANKRD28-215ENST00000624145 CBWD6Q4V339 395 aa4.12□□□□□ -1.75
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ANKRD28-215ENST00000624145 ARPINQ7Z6K5 226 aa4.12□□□□□ -1.75
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ANKRD28-215ENST00000624145 CD302Q8IX05 232 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 FBXO39Q8N4B4 442 aa4.12□□□□□ -1.75
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ANKRD28-215ENST00000624145 OR10H5Q8NGA6 315 aa4.12□□□□□ -1.75
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ANKRD28-215ENST00000624145 ZBTB10Q96DT7 871 aa4.12□□□□□ -1.75
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ANKRD28-215ENST00000624145 MAPRE3Q9UPY8 281 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 MYRFQ9Y2G1 1151 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 PP2D1A8MPX8 630 aa4.12□□□□□ -1.75
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ANKRD28-215ENST00000624145 OR10H2O60403 315 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 OR7A10O76100 309 aa4.12□□□□□ -1.75
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ANKRD28-215ENST00000624145 PRKAA2P54646 552 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
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ANKRD28-215ENST00000624145 PKN1Q16512 942 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 MILR1Q7Z6M3 343 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 STK32CQ86UX6 486 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 ARHGEF19Q8IW93 802 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 FAM126BQ8IXS8 530 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 ITFG1Q8TB96 612 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 AP3S1Q92572 193 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 TESCQ96BS2 214 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 PPP1R16AQ96I34 528 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 RNF145Q96MT1 663 aa4.12□□□□□ -1.75
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