RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM270Q6UE05 265 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 LRSAM1Q6UWE0 723 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 UNC45BQ8IWX7 931 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 BTBD1Q9H0C5 482 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 IRAK2O43187 625 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 TBL1XO60907 577 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 SEMA4FO95754 770 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 CD70P32970 193 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 SLC11A2P49281 568 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 FMO5P49326 533 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 CNGA2Q16280 664 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 KIF19Q2TAC6 998 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 NUGGCQ68CJ6 796 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 AZIN2Q96A70 460 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 ZSWIM1Q9BR11 485 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 TM9SF3Q9HD45 589 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 SUN2Q9UH99 717 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 LHX6Q9UPM6 363 aa25.92■■□□□ 1.74
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PTPRF-216ENST00000617451 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 PIK3R2O00459 728 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 PMM2O15305 246 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 FLRT2O43155 660 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 ACSL4O60488 711 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 SMC2O95347 1197 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 DNTTP04053 509 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 SLC6A4P31645 630 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA1Q92805 767 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 BIRC7Q96CA5 298 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 LMLNQ96KR4 655 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 NT5C1BQ96P26 610 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 CDC6Q99741 560 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 TOR4AQ9NXH8 423 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 SNX11Q9Y5W9 270 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 LTFP02788 710 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
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PTPRF-216ENST00000617451 TEAD4Q15561 434 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 ENGASEQ8NFI3 743 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 RHBDD1Q8TEB9 315 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 CLEC4CQ8WTT0 213 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 TTC17Q96AE7 1141 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 HSFY1Q96LI6 401 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 SGK2Q9HBY8 427 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 M0QYV0 167 aa25.89■■□□□ 1.74
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PTPRF-216ENST00000617451 CD27P26842 260 aa25.89■■□□□ 1.74
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PTPRF-216ENST00000617451 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
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PTPRF-216ENST00000617451 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 NADSYN1Q6IA69 706 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 MFN1Q8IWA4 741 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 PPM1KQ8N3J5 372 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 FIBINQ8TAL6 211 aa25.89■■□□□ 1.74
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PTPRF-216ENST00000617451 SMARCE1Q969G3 411 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 MYO19Q96H55 970 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 ACACAQ13085 2346 aa25.89■■□□□ 1.74
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PTPRF-216ENST00000617451 FSBPO95073 299 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 BRD2P25440 801 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 LMO3Q8TAP4 145 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 ORAI3Q9BRQ5 295 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 MTG2Q9H4K7 406 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 STIM2Q9P246 746 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 BTBD3Q9Y2F9 522 aa25.88■■□□□ 1.73
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PTPRF-216ENST00000617451 CALCAP01258 141 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 FYNP06241 537 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 IGSF8Q969P0 613 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 MYEOVQ96EZ4 313 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 CEP63Q96MT8 703 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 SCML1Q9UN30 329 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 PTPRBP23467 1997 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 PSMA7O14818 248 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 LAYNQ6UX15 382 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 USP30Q70CQ3 517 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
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