RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576		E9PAM4	449 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	EPHB2	P29323	1055 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC6A4	P31645	630 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	PTPN7	P35236	360 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	VIPR2	P41587	438 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	MTHFR	P42898	656 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	TPI1	P60174	286 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADGRF1	Q5T601	910 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	FBXL22	Q6P050	247 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q6ZNB5	142 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	HTR3D	Q70Z44	454 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	VSIG1	Q86XK7	387 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	PQLC3	Q8N755	202 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	AZIN2	Q96A70	460 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAF2	Q96CS3	445 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	ASB16	Q96NS5	453 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDH7	Q9ULB5	785 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	NEU3	Q9UQ49	428 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	NR2E1	Q9Y466	385 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576		H3BRJ5	948 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	CST8	O60676	142 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	AMPD1	P23109	780 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	MTA1	Q13330	715 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	TUBB2A	Q13885	445 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	RFX6	Q8HWS3	928 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMARCD2	Q92925	531 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYADM	Q96S97	322 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	DCLK3	Q9C098	648 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	MPP6	Q9NZW5	540 aa		9.46	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	DAPK3	O43293	454 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	TJP3	O95049	919 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	TACR2	P21452	398 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	PAFAH1B1	P43034	410 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	IRAK1	P51617	712 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	DPYS	Q14117	519 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	SUSD6	Q92537	303 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGSF8	Q969P0	613 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNF14	Q9UBS8	474 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	E2F8	A0AVK6	867 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF487	B1APH4	448 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	HCAR3	P49019	387 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF77	Q15935	545 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRC31	Q6UY01	552 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	LGI2	Q8N0V4	545 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	VCAN	P13611	3396 aa		9.45	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576		F5H5T6	163 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	LATS1	O95835	1130 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	ERCC2	P18074	760 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	WEE1	P30291	646 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	USP4	Q13107	963 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	BBS12	Q6ZW61	710 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLD5	Q8N7P1	536 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	HAUS1	Q96CS2	278 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	STIM2	Q9P246	746 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRIO	O75962	3097 aa		9.44	□□□□□ -0.9

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms