RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKS4BQ8N8V4 417 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 C12orf29Q8N999 325 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 SPATA18Q8TC71 538 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 HAUS1Q96CS2 278 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 CABS1Q96KC9 395 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 PAK5Q9P286 719 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 LIMD1Q9UGP4 676 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 CASTOR2A6NHX0 329 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 FSBPO95073 299 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 CD48P09326 243 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 ETS1P14921 441 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 BRAFP15056 766 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 DYNLT1P63172 113 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 XRCC4Q13426 336 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 EFHC2Q5JST6 749 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 RTP2Q5QGT7 225 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM130Q8N3G9 435 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 APPL2Q8NEU8 664 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 PWWP2AQ96N64 755 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 SCN1AP35498 2009 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 PPEF2O14830 753 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 CHADO15335 359 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP26.29■■□□□ 1.85e-9■□□□□ 8.4
CAPNS1-204ENST00000587718 KLHL38Q2WGJ6 581 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 EFHC1Q5JVL4 640 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 STRADAQ7RTN6 431 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 UBALD2Q8IYN6 164 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 PDIK1LQ8N165 341 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC197Q8NCU1 140 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM172AQ8WUF8 416 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 CKAP2Q8WWK9 683 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 PLCD4Q9BRC7 762 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 PCDH18Q9HCL0 1135 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 DPP7Q9UHL4 492 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.89e-10■■■■□ 24.3
CAPNS1-204ENST00000587718 WDFY4Q6ZS81 3184 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 DENND4AQ7Z401 1863 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 APOL1O14791 398 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 TGM5O43548 720 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 ASGR2P07307 311 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 MAGEA6P43360 314 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 DPYSL2Q16555 572 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC149Q6ZUS6 474 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 PRUNE1Q86TP1 453 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC38A7Q9NVC3 462 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 SAMD15Q9P1V8 674 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 NME7Q9Y5B8 376 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIP11Q15643 1979 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 HUS1O60921 280 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 RFPL2O75678 378 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 SPATA31D3P0C874 917 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 NR2C2P49116 596 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 QPCTQ16769 361 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 IER5LQ5T953 404 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC121Q6ZUS5 278 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 TRABD2AQ86V40 505 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 UNC45BQ8IWX7 931 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC13Q8IYE1 715 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 CNPY4Q8N129 248 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 HASPINQ8TF76 798 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 SMOC2Q9H3U7 446 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-204ENST00000587718 PLXNA3P51805 1871 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 RPL17P18621 184 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 RGS7P49802 495 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 GDF10P55107 478 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC8A3P57103 927 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 OTOP3Q7RTS5 596 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 ZBED8Q8IZ13 594 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 PLD5Q8N7P1 536 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 PYROXD1Q8WU10 500 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 DYDC1Q8WWB3 177 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 KDM4CQ9H3R0 1056 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
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