RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 PPM1NQ8N819 430 aa21.57■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 RNF208Q9H0X6 261 aa21.57■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 CRISPLD1Q9H336 500 aa21.57■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 SMYD2Q9NRG4 433 aa21.57■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa21.57■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 LRFN2Q9ULH4 789 aa21.57■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 F9P00740 461 aa21.56■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 CASC4Q6P4E1 433 aa21.56■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 SRLQ86TD4 932 aa21.56■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 IRGQQ8WZA9 623 aa21.56■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 SPOCK2Q92563 424 aa21.56■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 SIGLEC10Q96LC7 697 aa21.56■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 FTHL17Q9BXU8 183 aa21.56■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa21.56■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 KANSL3Q9P2N6 904 aa21.56■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 SLC17A6Q9P2U8 582 aa21.56■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 GRID1Q9ULK0 1009 aa21.56■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 TRIM66O15016 1216 aa21.56■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 STX2P32856 288 aa21.56■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 FAAP100Q0VG06 881 aa21.56■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa21.56■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 UNC5AQ6ZN44 842 aa21.56■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 NDFIP2Q9NV92 336 aa21.56■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa21.56■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 UBP1Q9NZI7 540 aa21.56■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 SLC24A2Q9UI40 661 aa21.56■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 FRMPD3Q5JV73 1810 aa21.56■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 BPTFQ12830 3046 aa21.55■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 WDR27A2RRH5 827 aa21.55■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 TBKBP1A7MCY6 615 aa21.55■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 SMAPO00193 183 aa21.55■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 ALDH2P05091 517 aa21.55■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 CYP2C18P33260 490 aa21.55■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 ADGRD1Q6QNK2 874 aa21.55■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 CES3Q6UWW8 571 aa21.55■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 SMC6Q96SB8 1091 aa21.55■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 CYTH2Q99418 400 aa21.55■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 MARCH5Q9NX47 278 aa21.55■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 TTLL3Q9Y4R7 772 aa21.55■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 FAM47DPA6NHR8 397 aa21.55■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 HACD1B0YJ81 288 aa21.55■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 PAGE1O75459 146 aa21.55■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 CPP00450 1065 aa21.55■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 FOXN2P32314 431 aa21.55■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 BFSP2Q13515 415 aa21.55■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 SEMA5AQ13591 1074 aa21.55■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 SLC1A5Q15758 541 aa21.55■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 RTP2Q5QGT7 225 aa21.55■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 USP33Q8TEY7 942 aa21.55■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 NLRC5Q86WI3 1866 aa21.55■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 DNM1LO00429 736 aa21.54■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 CA4P22748 312 aa21.54■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 MAGEA6P43360 314 aa21.54■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 ZBTB17Q13105 803 aa21.54■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 EPAS1Q99814 870 aa21.54■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 DHRS4Q9BTZ2 278 aa21.54■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 ABCC13Q9NSE7 274 aa21.54■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 MPP6Q9NZW5 540 aa21.54■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 IRAK2O43187 625 aa21.54■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 PTPN3P26045 913 aa21.54■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 GLUD2P49448 558 aa21.54■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 KLHL38Q2WGJ6 581 aa21.54■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 NUGGCQ68CJ6 796 aa21.54■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 APOL2Q9BQE5 337 aa21.54■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 GMIPQ9P107 970 aa21.54■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 SCN5AQ14524 2016 aa21.54■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 DFFAO00273 331 aa21.53■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 C1QAP02745 245 aa21.53■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 F7P08709 466 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 CPB1P15086 417 aa21.53■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 RPL17P18621 184 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 C14orf80Q86SX3 495 aa21.53■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 SERAC1Q96JX3 654 aa21.53■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 PHACTR1Q9C0D0 580 aa21.53■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 GGT7Q9UJ14 662 aa21.53■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 WDR91A4D1P6 747 aa21.53■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 IGLV3-25P01717 112 aa21.53■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 MGAT1P26572 445 aa21.53■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa21.53■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 MCUQ8NE86 351 aa21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms