RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549362.1

USP25-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, human

TSL 2

Gene USP25, Length 606 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP25-210	ENST00000549362	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	SCLT1	Q96NL6	688 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	SAMD11	Q96NU1	681 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	ZIM3	Q96PE6	472 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	SPAG5	Q96R06	1193 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	EYA3	Q99504	573 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	PTPN18	Q99952	460 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	RAB17	Q9H0T7	212 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	ISCU	Q9H1K1	167 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	CERS4	Q9HA82	394 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	IRAK3	Q9Y616	596 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	MYH1	P12882	1939 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	SCN7A	Q01118	1682 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	C2orf78	A6NCI8	922 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	POM121B	A6NF01	834 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	PP2D1	A8MPX8	630 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	SNAP23	O00161	211 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	ZNF185	O15231	689 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	FRS3	O43559	492 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	NMT2	O60551	498 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	PALM	O75781	387 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	TOX4	O94842	621 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	FAM107A	O95990	144 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	COL6A1	P12109	1028 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	FCER1A	P12319	257 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	FER	P16591	822 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	STT3A	P46977	705 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	RENBP	P51606	427 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	MAPK10	P53779	464 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	DLG4	P78352	724 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	GUCY2D	Q02846	1103 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	TLE1	Q04724	770 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	DDR1	Q08345	913 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	COASY	Q13057	564 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	CNGA2	Q16280	664 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	ALF	Q53S48	1182 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	ODF2	Q5BJF6	829 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	HYI	Q5T013	277 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67	2e-8	■■■■■ 32
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USP25-210	ENST00000549362	PCGF5	Q86SE9	256 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	TEX11	Q8IYF3	940 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	CNPY4	Q8N129	248 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	PAF1	Q8N7H5	531 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	IL31RA	Q8NI17	732 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	MDM1	Q8TC05	714 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	IFI44	Q8TCB0	444 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	IFT81	Q8WYA0	676 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	LPP	Q93052	612 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	MTMR9	Q96QG7	549 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	KRT12	Q99456	494 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	PLIN2	Q99541	437 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	TLR10	Q9BXR5	811 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP25-210	ENST00000549362	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67

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