RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 CDR2Q01850 454 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 GAS6Q14393 721 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 KRT31Q15323 416 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 CSRP2Q16527 193 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 MIIPQ5JXC2 388 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 PIK3R6Q5UE93 754 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 CDKAL1Q5VV42 579 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 FYB2Q5VWT5 728 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 DENND1BQ6P3S1 775 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC26A9Q7LBE3 791 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 ARCQ7LC44 396 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 CYP2U1Q7Z449 544 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 DSG4Q86SJ6 1040 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC47A2Q86VL8 602 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 RASSF3Q86WH2 238 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 CHSY1Q86X52 802 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 IRF2BP1Q8IU81 584 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC33Q8N5R6 958 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 FIBINQ8TAL6 211 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 GPT2Q8TD30 523 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 KAT5Q92993 513 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 BHMTQ93088 406 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM11Q96F44 468 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 SIPA1Q96FS4 1042 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 ERGIC2Q96RQ1 377 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 GABRG3Q99928 467 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 PCED1AQ9H1Q7 454 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 DDIT4Q9NX09 232 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 TAB2Q9NYJ8 693 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 PLK2Q9NYY3 685 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 GGA2Q9UJY4 613 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 IGSF10Q6WRI0 2623 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 ITPR1Q14643 2758 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1B0GVM2 712 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 TCAF2A6NFQ2 919 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 TULP2O00295 520 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 CBFA2T2O43439 604 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 HRO43593 1189 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 GREM1O60565 184 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 TSPAN3O60637 253 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 DAB1O75553 588 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 EPN2O95208 641 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 IGLV3-27P01718 113 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 KLKB1P03952 638 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 DNTTP04053 509 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF806P0C7X5 589 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 HOXC13P31276 330 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 SDC4P31431 198 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 CLCN1P35523 988 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 GABRB2P47870 512 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 CREB5Q02930 508 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 DEUP1Q05D60 604 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC25A52Q3SY17 297 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 PLK5Q496M5 336 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 ANO6Q4KMQ2 910 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 C6orf118Q5T5N4 469 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM46CQ5VWP2 391 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 LYSMD4Q5XG99 296 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 CHST9Q7L1S5 443 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 KBTBD6Q86V97 674 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 SYT12Q8IV01 421 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 PASD1Q8IV76 773 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 LGI2Q8N0V4 545 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 CARNMT1Q8N4J0 409 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 AOPEPQ8N6M6 819 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 MDGA1Q8NFP4 955 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 RIN3Q8TB24 985 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 C1orf74Q96LT6 269 aa5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms