RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544244.5

PTPRO-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRO, Length 3,978 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-210ENST00000544244 ARHGEF15O94989 841 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ECEL1O95672 775 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 TACR2P21452 398 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 KCNA5P22460 613 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 L1CAMP32004 1257 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 HDAC4P56524 1084 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 NTHL1P78549 312 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 OGDHQ02218 1023 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 GRIN2CQ14957 1233 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 MPPE1Q53F39 396 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 C6orf118Q5T5N4 469 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 IL31Q6EBC2 164 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 MFSD7Q6UXD7 560 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ATPAF2Q8N5M1 289 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 DEFB123Q8N688 67 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CCHCR1Q8TD31 782 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 KRT35Q92764 455 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF670Q9BS34 389 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ZYG11BQ9C0D3 744 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 PIGVQ9NUD9 493 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 FZD10Q9ULW2 581 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CFAP69A5D8W1 941 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 NFATC1O95644 943 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 F11P03951 625 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 TUBBP07437 444 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 PYGMP11217 842 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 AMPD1P23109 780 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 MAPK1P28482 360 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CHRNA3P32297 505 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 OCLNQ16625 522 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 AAK1Q2M2I8 961 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 MTSS1LQ765P7 747 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 SPRED2Q7Z698 418 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 GPR149Q86SP6 731 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 HOOK3Q86VS8 718 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CMTM8Q8IZV2 173 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 BBOF1Q8ND07 529 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 UCMAQ8WVF2 138 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CYP2S1Q96SQ9 504 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 KRT12Q99456 494 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 OSBPL2Q9H1P3 480 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 PCDH18Q9HCL0 1135 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 IL37Q9NZH6 218 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 C2orf78A6NCI8 922 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 NCAM2O15394 837 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ADH1CP00326 375 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 KRT10P13645 584 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 TGM2P21980 687 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ADCY8P40145 1251 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ST8SIA6P61647 398 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 HYAL1Q12794 435 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 IER5LQ5T953 404 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 TPGS1Q6ZTW0 290 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 RFX8Q6ZV50 586 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CPA6Q8N4T0 437 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC185Q8N715 623 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 SHKBP1Q8TBC3 707 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 C1orf54Q8WWF1 131 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 BHMTQ93088 406 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 RNF157Q96PX1 679 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 BRD8Q9H0E9 1235 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ADAM7Q9H2U9 754 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 GDE1Q9NZC3 331 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CDH7Q9ULB5 785 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 NR2E1Q9Y466 385 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 E2F8A0AVK6 867 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 LEFTY2O00292 366 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 RAMP2O60895 175 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 TBL1XO60907 577 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CLDN11O75508 207 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 OR1E1P30953 314 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 SOX11P35716 441 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 NR2C2P49116 596 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 SARNPP82979 210 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 AP1B1Q10567 949 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ADAM15Q13444 863 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 MAP9Q49MG5 647 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ADGRF1Q5T601 910 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CFAP58Q5T655 872 aa5.84□□□□□ -1.47
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