RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 ADGRD1Q6QNK2 874 aa20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 IGDCC3Q8IVU1 814 aa20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 GDAP1Q8TB36 358 aa20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF139Q8WU17 664 aa20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC9A7Q96T83 725 aa20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 PAFAH2Q99487 392 aa20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGEF4Q9NR80 690 aa20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 KIAA1671Q9BY89 1806 aa20.89■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 AIF1P55008 147 aa20.89■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP20.89■□□□□ 0.933e-6■■■■□ 20.5
PACSIN3-211ENST00000539589 FAXCQ5TGI0 409 aa20.89■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 PM20D1Q6GTS8 502 aa20.89■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC121Q6ZUS5 278 aa20.89■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.89■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 MCUQ8NE86 351 aa20.89■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 SCAMP5Q8TAC9 235 aa20.89■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC7A14Q8TBB6 771 aa20.89■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRN4Q8WUT4 740 aa20.89■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 MAGEB18Q96M61 343 aa20.89■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 OLFM3Q96PB7 478 aa20.89■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 GREB1Q4ZG55 1949 aa20.89■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 TNFRSF10BO14763 440 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 IL9RQ01113 521 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF280DQ6N043 979 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM199Q8N511 208 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 PGLYRP2Q96PD5 576 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 PIGVQ9NUD9 493 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 AVILO75366 819 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 SPAG7O75391 227 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 VNN2O95498 520 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 AMHP03971 560 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 GRIK1P39086 918 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 GPR15P49685 360 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 ITIH4Q14624 930 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 TTC9BQ8N6N2 239 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 STKLD1Q8NE28 680 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 HTR3CQ8WXA8 447 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 FERMT1Q9BQL6 677 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 PNPLA8Q9NP80 782 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 RRN3Q9NYV6 651 aa20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM182AQ5T1J6 154 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 SDHAF4Q5VUM1 108 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 ATAD1Q8NBU5 361 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 NTAN1Q96AB6 310 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC39Q96DD0 335 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 IGSF21Q96ID5 467 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 OR6C75A6NL08 312 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 CREB3O43889 395 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 METTL18O95568 372 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 LTFP02788 710 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 NCAM1P13591 858 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 TPSB2P20231 275 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 ADRA1BP35368 520 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 TPSAB1Q15661 275 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 NUGGCQ68CJ6 796 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 OTOP2Q7RTS6 562 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 C4orf33Q8N1A6 199 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC33Q8N5R6 958 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 DCAKDQ8WVC6 231 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 PPM1EQ8WY54 764 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 TTPALQ9BTX7 342 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 CRISPLD1Q9H336 500 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 KIF9Q9HAQ2 790 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 IL23AQ9NPF7 189 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 IKBKGQ9Y6K9 419 aa20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 STK10O94804 968 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 PGFP49763 221 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC5A3P53794 718 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 ARPP19P56211 112 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 SCN4BQ8IWT1 228 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 DENND1AQ8TEH3 1009 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 PLXNA3P51805 1871 aa20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A0A0MRY4 1105 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A1W2PPM1 405 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 ADAM12O43184 909 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 MFSD11O43934 449 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 KRT4P19013 534 aa20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3-211ENST00000539589 WDR4P57081 412 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
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