RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517215.1

RNU6-1238P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1238, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1238P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZFAND5O76080 213 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 C9P02748 559 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PFKMP08237 780 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MELTFP08582 738 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PRSS56P0CW18 603 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GP9P14770 177 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZNF44P15621 663 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ELK1P19419 428 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ITGALP20701 1170 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 IL4RP24394 825 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FASP25445 335 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GRIA2P42262 883 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PEX5P50542 639 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 COPB1P53618 953 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 NLRP5P59047 1200 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MECOMQ03112 1051 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GRAPQ13588 217 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TUBB2AQ13885 445 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 NCAPHQ15003 741 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 C3AR1Q16581 482 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 IQCCQ4KMZ1 466 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CACHD1Q5VU97 1274 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 DCAF12L2Q5VW00 463 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ISM2Q6H9L7 571 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ANKS3Q6ZW76 656 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 VASH2Q86V25 355 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PLD3Q8IV08 490 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 NAXDQ8IW45 347 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ADGRF4Q8IZF3 695 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GSTCDQ8NEC7 633 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 C17orf47Q8NEP4 570 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SOCS4Q8WXH5 440 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 DHX58Q96C10 678 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ALG14Q96F25 216 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SMOQ99835 787 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MYOCQ99972 504 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 IER2Q9BTL4 223 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 HTATIP2Q9BUP3 242 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TUBB2BQ9BVA1 445 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PANK2Q9BZ23 570 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 AAMDCQ9H7C9 122 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TMEM181Q9P2C4 612 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TUBE1Q9UJT0 475 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 AMFRQ9UKV5 643 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZNF711Q9Y462 761 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ASXL2Q76L83 1435 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1238P-201ENST00000517215 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TMEM88BA6NKF7 163 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MS4A18H0YCH9 400 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 I6L893 689 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 AP4M1O00189 453 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ERC2O15083 957 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FYB1O15117 783 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 LIASO43766 372 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SERPINI2O75830 405 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 KRT33AO76009 404 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PRKD3O94806 890 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SOX30O94993 753 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 APOL3O95236 402 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MOCS3O95396 460 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TNFRSF6BO95407 300 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GNAI2P04899 355 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CYP17A1P05093 508 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 LDHBP07195 334 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CTSHP09668 335 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CGB3P0DN86 165 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ACADMP11310 421 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC5A1P13866 664 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FOLR2P14207 255 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 NAT1P18440 290 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MDKP21741 143 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MCM3P25205 808 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CANXP27824 592 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CD34P28906 385 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TYK2P29597 1187 aa-0.6□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms