RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.31
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RABGEF1-211ENST00000503687 PKNOX1P55347 436 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGEF1-211ENST00000503687 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
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RABGEF1-211ENST00000503687 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
RABGEF1-211ENST00000503687 CSPG4P5Q96PW8 444 aa13.12□□□□□ -0.31
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RABGEF1-211ENST00000503687 CDY1Q9Y6F8 540 aa13.12□□□□□ -0.31
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RABGEF1-211ENST00000503687 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM228AQ86W67 206 aa13.11□□□□□ -0.31
RABGEF1-211ENST00000503687 ANKRD52Q8NB46 1076 aa13.11□□□□□ -0.31
RABGEF1-211ENST00000503687 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa13.11□□□□□ -0.31
RABGEF1-211ENST00000503687 FNIP1Q8TF40 1166 aa13.11□□□□□ -0.31
RABGEF1-211ENST00000503687 SENP8Q96LD8 212 aa13.11□□□□□ -0.31
RABGEF1-211ENST00000503687 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
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