RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489095.1

TRBV5-2-201, Transcript of T cell receptor beta variable 5-2 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene TRBV5-2, Length 273 nt, Biotype TR V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-2-201ENST00000489095 NDUFV1P49821 464 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 RASSF2P50749 326 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 PLXNA3P51805 1871 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 NRLP54845 237 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 CDK18Q07002 472 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 MGAT5Q09328 741 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 FAAP100Q0VG06 881 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 GALNT2Q10471 571 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 AP1B1Q10567 949 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 WASHC5Q12768 1159 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 BNIP1Q12981 228 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 NOGQ13253 232 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 RIPK1Q13546 671 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 LPIN1Q14693 890 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 SLC1A5Q15758 541 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 KCNA10Q16322 511 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 SPANXN3Q5MJ09 141 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 FAXCQ5TGI0 409 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 SYPL2Q5VXT5 272 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 ATG16L1Q676U5 607 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 FAM47EQ6ZV65 393 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 SH2D5Q6ZV89 423 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 ZNF534Q76KX8 674 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 LINC00523Q86TU6 105 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 PACS2Q86VP3 889 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 ECHDC2Q86YB7 292 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 LRRC49Q8IUZ0 686 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 PYROXD2Q8N2H3 581 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 ARHGAP18Q8N392 663 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 LZTR1Q8N653 840 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 RNF169Q8NCN4 708 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 CCNYQ8ND76 341 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 TCP10LQ8TDR4 215 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 LPPQ93052 612 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 ATP2A3Q93084 1043 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 LRRC37BQ96QE4 947 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 HAPLN3Q96S86 360 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 LGMNQ99538 433 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 PKMYT1Q99640 499 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 ADAM2Q99965 735 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 SIKE1Q9BRV8 207 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 GBA3Q9H227 469 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 SMOC2Q9H3U7 446 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 KIF9Q9HAQ2 790 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 SLC40A1Q9NP59 571 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 ABCC13Q9NSE7 274 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 ABCF3Q9NUQ8 709 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 DONSONQ9NYP3 566 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 TXNDC16Q9P2K2 825 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 ADAM28Q9UKQ2 775 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 MYO16Q9Y6X6 1858 aa6.12□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 C2CD2LO14523 706 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 IRAK2O43187 625 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 MAP3K6O95382 1288 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 AP2A1O95782 977 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 GNRH1P01148 92 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 IGLV3-25P01717 112 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 USP17L7P0C7H9 530 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 SRGAP2BP0DMP2 458 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 SLC2A3P11169 496 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 PYGBP11216 843 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 NEFHP12036 1026 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 CCNB1P14635 433 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 PSMB4P28070 264 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 CTGFP29279 349 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 HOXC13P31276 330 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 HADHAP40939 763 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 GARSP41250 739 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 ETV4P43268 484 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 MAGEA11P43364 429 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 SERPINB4P48594 390 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 NPY2RP49146 381 aa6.11□□□□□ -1.43
TRBV5-2-201ENST00000489095 NCALDP61601 193 aa6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms