RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485407.1

NHLRC3-205, Transcript of NHL repeat containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene NHLRC3, Length 623 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3-205ENST00000485407 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.01□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 TRIM43BA6NCK2 446 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 AQP12BA6NM10 295 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 B4E171 279 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 TISP43B9A030 160 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 B9A039 149 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 PODXLO00592 558 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 AREL1O15033 823 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 ARHGAP6O43182 974 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 THAP12O43422 761 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 ATP1A3P13637 1013 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 INSRRP14616 1297 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 TSPAN7P41732 249 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 TXKP42681 527 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 APBA1Q02410 837 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 CREMQ03060 361 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 SLC14A2Q15849 920 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 TMEM266Q2M3C6 531 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 SPATA1Q5VX52 437 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 HAUS3Q68CZ6 603 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 OTUD6AQ7L8S5 288 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 LRRTM4Q86VH4 590 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 C4orf32Q8N8J7 132 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 NUP43Q8NFH3 380 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 TET1Q8NFU7 2136 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 WDR48Q8TAF3 677 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 SNX22Q96L94 193 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 CTAGE1Q96RT6 745 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 SERINC2Q96SA4 455 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 DMRTA2Q96SC8 542 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 MANSC1Q9H8J5 431 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 BRD9Q9H8M2 597 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 SETD4Q9NVD3 440 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 TUBE1Q9UJT0 475 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 MTMR6Q9Y217 621 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 SQORQ9Y6N5 450 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 MAST4O15021 2626 aa6□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 A0A0A6YYJ9 748 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 CHMP2AO43633 222 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 ENDOD1O94919 500 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 SLITRK3O94933 977 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 TBX18O95935 607 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 IQCF3P0C7M6 154 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 CKBP12277 381 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 PRKCAP17252 672 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 FSTP19883 344 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 MALP21145 153 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 RPA1P27694 616 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 TMOD1P28289 359 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 PER3P56645 1201 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 MVKQ03426 396 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 ACAP1Q15027 740 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 SLC45A4Q5BKX6 768 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 FBXO47Q5MNV8 452 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 WDR45BQ5MNZ6 344 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 MARCH8Q5T0T0 291 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 GALNT18Q6P9A2 607 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 MTHFD1LQ6UB35 978 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 LRSAM1Q6UWE0 723 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 RNF44Q7L0R7 432 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 MOGAT3Q86VF5 341 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 PRSS33Q8NF86 280 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 CCHCR1Q8TD31 782 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 UCMAQ8WVF2 138 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 AK8Q96MA6 479 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 LXNQ9BS40 222 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 G6PC3Q9BUM1 346 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 WDCPQ9H6R7 721 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 C7orf69Q9H7B7 122 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 RXFP1Q9HBX9 757 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 TUFT1Q9NNX1 390 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 SLC39A2Q9NP94 309 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 TM7SF3Q9NS93 570 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 ANKEF1Q9NU02 776 aa5.99□□□□□ -1.45
NHLRC3-205ENST00000485407 KIF17Q9P2E2 1029 aa5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms