RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 CFAP52Q8N1V2 620 aa21.69■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 JOSD2Q8TAC2 188 aa21.69■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 FIBINQ8TAL6 211 aa21.69■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 LMLNQ96KR4 655 aa21.69■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 CFAP57Q96MR6 1250 aa21.69■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 ANLNQ9NQW6 1124 aa21.69■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 ABCB8Q9NUT2 735 aa21.69■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa21.69■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 TAS2R14Q9NYV8 317 aa21.69■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 I6L893 689 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 AXIN1O15169 862 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 PAGE1O75459 146 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 ENDOD1O94919 500 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 ADCY5O95622 1261 aa21.68■■□□□ 1.06
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ACTB-211ENST00000480301 MTA1Q13330 715 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 ADIPOR2Q86V24 386 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 MFN1Q8IWA4 741 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 CHPFQ8IZ52 775 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 RNF214Q8ND24 703 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 RXFP2Q8WXD0 754 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 GABRG3Q99928 467 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 WDCPQ9H6R7 721 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 TMEM51Q9NW97 253 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 GGA2Q9UJY4 613 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 HS3ST4Q9Y661 456 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PQF6 199 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
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ACTB-211ENST00000480301 WASH3PC4AMC7 463 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 F5H5T6 163 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 TIMM44O43615 452 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 SKILP12757 684 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 CD70P32970 193 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 KLHL30Q0D2K2 578 aa21.67■■□□□ 1.06
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ACTB-211ENST00000480301 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 CCDC14Q49A88 953 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 BRMS1LQ5PSV4 323 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 FBXL22Q6P050 247 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP21.67■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 CHST9Q7L1S5 443 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 MCOLN2Q8IZK6 566 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 C3orf20Q8ND61 904 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 UCMAQ8WVF2 138 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 CPLX3Q8WVH0 158 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 IQCDQ96DY2 449 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 TKTL2Q9H0I9 626 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 CD248Q9HCU0 757 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 CAPN11Q9UMQ6 739 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 ITIH6Q6UXX5 1313 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 SIGLEC16A6NMB1 481 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 KRT3P12035 628 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 HOXB2P14652 356 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 PDGFRAP16234 1089 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 ZBED6P86452 979 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 ENPP2Q13822 863 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 FSCBQ5H9T9 825 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 HGSNATQ68CP4 663 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 SDE2Q6IQ49 451 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 ANO7Q6IWH7 933 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 C14orf80Q86SX3 495 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 CARNMT1Q8N4J0 409 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 MDGA1Q8NFP4 955 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 SORCS1Q8WY21 1168 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 IGSF8Q969P0 613 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 CIPCQ9C0C6 399 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 STON1Q9Y6Q2 735 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP21.65■■□□□ 1.061e-323■□□□□ 8.9
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ACTB-211ENST00000480301 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
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ACTB-211ENST00000480301 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 GGCXP38435 758 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 IL12RB1P42701 662 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 PTPN9P43378 593 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 ATP11AP98196 1134 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 LMAN2Q12907 356 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 RAB6CQ53S08 254 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 MBLAC2Q68D91 279 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 KIAA1211LQ6NV74 962 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 WDR59Q6PJI9 974 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 AHI1Q8N157 1196 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 GAB3Q8WWW8 586 aa21.65■■□□□ 1.06
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