RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470095.5

HPS1-209, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-209ENST00000470095 HARS2P49590 506 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 IRAK1P51617 712 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 AUHQ13825 339 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 TFDP2Q14188 446 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 RAP1GAP2Q684P5 730 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 CHSY1Q86X52 802 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 DENND1CQ8IV53 801 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 NPAS3Q8IXF0 933 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 RIN3Q8TB24 985 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 ATG4AQ8WYN0 398 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 HAUS1Q96CS2 278 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 TBC1D31Q96DN5 1066 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 MYEOVQ96EZ4 313 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 ZSWIM3Q96MP5 696 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 DCLK3Q9C098 648 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 ADAM7Q9H2U9 754 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 CFAP97Q9P2B7 532 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 ZMYM5Q9UJ78 669 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 STOML2Q9UJZ1 356 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 DOCK8Q8NF50 2099 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 TRANK1O15050 2925 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 LEFTY2O00292 366 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 PHF2O75151 1096 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 APOC2P02655 101 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 ERCC2P18074 760 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 TACR2P21452 398 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 TGM2P21980 687 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 IGFBP4P22692 258 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 FSHRP23945 695 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 EPHB2P29323 1055 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 SLC11A2P49281 568 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 USP4Q13107 963 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 FBXL22Q6P050 247 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 TTC27Q6P3X3 843 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 NPNTQ6UXI9 565 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 FAM217AQ8IXS0 508 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 MMGT1Q8N4V1 131 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 ACTL9Q8TC94 416 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 SH3RF2Q8TEC5 729 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 C1orf54Q8WWF1 131 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 MSLNLQ96KJ4 702 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 FAM118BQ9BPY3 351 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 CLDND1Q9NY35 253 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 VANGL2Q9ULK5 521 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 CCL26Q9Y258 94 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 DRGXA6NNA5 263 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 GFRA2O00451 464 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 MFSD11O43934 449 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 TCF3P15923 654 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 WEE1P30291 646 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 AVPR1AP37288 418 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 NOMO1Q15155 1222 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 ZNF77Q15935 545 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 C5orf22Q49AR2 442 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 HTR3DQ70Z44 454 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 NLRP14Q86W24 1093 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 NPWQ8N729 165 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 SLC35B2Q8TB61 432 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 IGSF8Q969P0 613 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 KLC2Q9H0B6 622 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 LRRC19Q9H756 370 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 WASH4PA8MWX3 477 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 F5H5T6 163 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 DAPK3O43293 454 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 LIASO43766 372 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 GBE1Q04446 702 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 CCNG2Q16589 344 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 ALFQ53S48 1182 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 ADGRF1Q5T601 910 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 RFWD3Q6PCD5 774 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-209ENST00000470095 C1orf228Q6PIY5 440 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms