RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GFPT2O94808 682 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CAVIN2O95810 425 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SDHBP21912 280 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 JAM2P57087 298 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANO6Q4KMQ2 910 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RAP1GAP2Q684P5 730 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LPCAT2Q7L5N7 544 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEFF1Q8IYR6 380 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LGI2Q8N0V4 545 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NETO1Q8TDF5 533 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC20A1Q8WUM9 679 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LMLNQ96KR4 655 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CD93Q9NPY3 652 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CYP8B1Q9UNU6 501 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LRRC10BA6NIK2 292 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KCNU1A8MYU2 1149 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF217O75362 1048 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LSM8O95777 96 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC2A3P11169 496 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HLA-EP13747 358 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TACR2P21452 398 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCR1P32246 355 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NOS2P35228 1153 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SOX5P35711 763 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GABRB2P47870 512 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NOMO3P69849 1222 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UBXN1Q04323 297 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NME3Q13232 169 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MBLAC2Q68D91 279 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TCEAL6Q6IPX3 200 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARMCX6Q7L4S7 300 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CYP2U1Q7Z449 544 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ERICH1Q86X53 443 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CARNMT1Q8N4J0 409 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FIBINQ8TAL6 211 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TCEAL3Q969E4 200 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RNF34Q969K3 372 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C18orf8Q96DM3 657 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RXFP3Q9NSD7 469 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PLA2G4CQ9UP65 541 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa16.12■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LAMA1P25391 3075 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CKAP5Q14008 2032 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EPHX1P07099 455 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ATP1A3P13637 1013 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ABCB4P21439 1286 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MATKP42679 507 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PTGER3P43115 390 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LMAN2Q12907 356 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CDH18Q13634 790 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PTPRNQ16849 979 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C2CD6Q53TS8 623 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FSCBQ5H9T9 825 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPDYCQ5MJ68 293 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NAA35Q5VZE5 725 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC36A4Q6YBV0 504 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ERMP1Q7Z2K6 904 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF677Q86XU0 584 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 XYLT1Q86Y38 959 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NEK11Q8NG66 645 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CPA5Q8WXQ8 436 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPAG5Q96R06 1193 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ADAM33Q9BZ11 813 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM245Q9H330 911 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NUP205Q92621 2012 aa16.11■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 F5H5T6 163 aa16.1■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 M0QYT0 321 aa16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms